Berdasarkan Sensus Penduduk Indonesia 2010, mayoritas penduduk kecamatan Meranti menganut agama Islam.[5][6] Adapun persentasi penduduk kecamatan ini menurut agama yang dianut yakni Islam sebanyak 69,49%, kemudian Kristen sebanyak 30,42% yang mana Protestan sebanyak 29,06% dan selebihnya Katolik sebanyak 1,36%. Sebagian kecil menganut agama Buddha sebanyak 0,02%, kemudian Hindu sebanyak 0,01% dan lainnya 0,06%.[5] Sementara untuk sarana rumah ibadah di kecamatan ini pada tahun 2021, terdapat 14 masjid, 19 musala, dan 23 gereja Protestan.[2]