Share to: share facebook share twitter share wa share telegram print page

Modifikasi histon

Modifikasi histon adalah serangkaian perubahan yang dialami oleh protein histon. Modifikasi histon yang umumnya dijumpai berupa metilasi, asetilasi, dan fosforilasi. Selain tiga modifikasi tersebut, terdapat beberapa modifikasi lain seperti deiminasi, penambahan gugus β-N-asetilglukosamin, ribosilasi ADP, ubikitinasi, dan sumoilasi.[1] Modifikasi pada protein ini merupakan salah satu subyek studi epigenomika dan ditemukan mempengaruhi ekspresi gen pada eukariota.

Tata Nama

Modifikasi pada histon memiliki tata cara penamaan khusus. Umumnya penamaan ini didasarkan pada tata cara penamaan Brno yang telah disepakati oleh konsorsium laboratorium Eropa. Penamaan Brno diambil dari nama kota di Republik Ceko tempat disepakatinya penamaan tersebut.[2][3] Pengaturannya dapat disederhanakan menjadi:

NAMAFAMILI.NOMORPARALOG.SUBTIPE.VARIASIPISAHPOSISIASAMAMINOTIPEMODIFIKASI.

Penulisan modifikasi dimulai dengan menyebut gelongan dari histon yang termodifikasi (H2A, H2B, H3 and H4, dan histon pentaut H1) dilanjutkan dengan tipe paralog berdasarkan urutan penemuan (1,2,3,4, dan seterusnya), kemudian subtipe jika ada, dan variasi pisah (splice variant), jika ada. Selanjutnya dilanjutkan dengan kode asam amino dan posisinya pada rantai protein histon. Terakhir, jenis modifikasi. Jenis modifikasi dapat diperpanjang dengan menggabungkan beberapa jenis modifikasi lain menjadi satu. Sebagai contoh, H3K27me3 berarti modifikasi berupa trimetilasi (me3) pada famili histon H3, pada asam amino ke-27 (K27).

Urutan asam amino dihitung berdasarkan hasil pengutasan protein (sequencing) dan tidak dihitung berdasarkan kerangka bacaan terbuka (open reading frame) gen histon. Sebagai contoh, histon H3.3 pada manusia memiliki posisi lisina pada urutan ke-10 jika diurut berdasarkan kerangka bacaan terbuka. Namun, pada umumnya metionina pada urutan asam amino dibuang apabila diikuti dengan alanina sebagaimana yang terjadi pada histon H3.3. Oleh sebab itu urutan lisina menjadi mundur sebanyak satu urutan dari 10 menjadi 9 sehingga modifikasi pada posisi ini ditulis sebagai H3.3K9.

Grup Modifikasi
  Asam amino termodifikasi
  Tingkat modifikasi
  Singkatan
  Contoh Penamaan
  Asetil-
  Lisina
  mono-
  ac
  H3K9ac
  Metil-
  Arginina
  mono-
  me1
  H3R17me1

  Arginina
  di-, simetris
  me2s
  H3R2me2s

  Arginina
  di-, asimetris
  me2a
  H3R17me2a

  Lisina
  mono-
  me1
  H3K4me1

  Lisina
  di-
  me2
  H3K4me2

  Lisina
  tri-
  me3
  H3K4me3
  Fosforil-
  Serina or treonina
  mono-
  ph
  H3S10ph
  Ubikitil-
  Lisina
  mono-
  ub1
  H2BK123ub1
  Sumoylil-
  Lisina
  mono-
  su
  H4K5su
  ADP ribosil-
  Glutamat
  mono-
  ar1
  H2BE2ar1

  Glutamat
  poli-
  arn
  H2BE2arn

Kode Histon

Beberapa modifikasi seperti H3K27me3 berasosiasi dengan peredaman gen. Sedangkan modifikasi lain seperti H3K4me3 berasosiasi dengan kenaikan ekspresi gen.[4]

   Kode Histon
   Peran Biologis
   H3R2me2a
   aktivasi gen
   H3T3ph
   mitosis
   H3K4ac
   aktivasi gen
   H3K4me1, me2, me3
   aktivasi gen
   H3R8me2s
   represi gen
   H3K9ac
   aktivasi gen
   H3K9me1, me2, me3
   represi gen
   H3S10ph
   mitosis
   H3S11ph
   mitosis
   H3K14ac
   aktivasi gen
   H3R17me2a
   aktivasi gen
   H3K18ac
   aktivasi gen
   H3K23ac
   aktivasi gen
   H3R26me2a
   aktivasi gen
   H3K27ac
   aktivasi gen
   H3K27me1, me2, me3
   represi gen
   H3S28ph
   mitosis
   H3K36me1, me2, me3
   aktivasi gen
   H3K56ac
   aktivasi gen
   H3K79me1, me2, me3
   aktivasi gen
   H4S1ph
   mitosis
   H4R3me2a
   aktivasi gen
   H4R3me2s
   represi gen
   H4K5ac
   aktivasi gen
   H4K8ac
   aktivasi gen
   H4K12ac
   aktivasi gen
   H4K16ac
   aktivasi gen
   H4K20me1, me2, me3
   aktivasi gen
   H4K91ac
   aktivasi gen
   H2AS1ph
   mitosis
   H2AK4ac
   aktivasi gen
   H2AK5ac
   aktivasi gen
   H2AK7ac
   aktivasi gen
   H2AT119ph
   mitosis
   H2AK126su
   represi gen
   H2AK119ub
   aktivasi gen
   H2AS129ph
   Reparasi DNA
   H2BK5ac
   aktivasi gen
   H2BS10ph
   apoptosis
   H2BK12ac
   aktivasi gen
   H2BS14ph
   apoptosis
   H2BK15ac
   aktivasi gen
   H2BK16ac
   aktivasi gen
   H2BK20ac
   aktivasi gen
   H2BS33ph
   aktivasi gen
   H2BK120ub
   meiosis

Referensi

  1. ^ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3193420/
  2. ^ http://www.epigeneticsandchromatin.com/content/5/1/7
  3. ^ http://www.nature.com/nsmb/journal/v12/n2/full/nsmb0205-110.html
  4. ^ Allis, C.D., Jenuwein, T., Reinberg, D. (2007). Epigenetics. Plainview, NY. Cold Spring Harbor Laboratory Press

Read other articles:

Virginia KirtleyVirginia KirtleyLahir(1888-11-11)11 November 1888Bowling Green, Missouri, Amerika SerikatMeninggal19 Agustus 1956(1956-08-19) (umur 67)Sherman Oaks, California, Amerika SerikatPekerjaanPemeran, penulis naskahTahun aktif1913-1928 Virginia Kirtley (11 November 1888 – 19 Agustus 1956) adalah seorang pemeran film dan penulis Amerika Serikat pada era film bisu. Ia tampil dalam 55 film pada 1910an dan 1920an.[1] Filmografi pilihan Sebagai pemeran: Mabe…

CheilinusRentang fosil: 87–0 jtyl PreЄ Є O S D C P T J K Pg N Late Cretaceous to Present[1] Cheilinus abudjubbe Klasifikasi ilmiah Kerajaan: Animalia Filum: Chordata Kelas: Actinopterygii Ordo: Labriformes Famili: Labridae Genus: CheilinusLacépède, 1801 Spesies Cheilinus abudjubbe Rüppell, 1835 Cheilinus chlorourus (Bloch, 1791) Cheilinus fasciatus (Bloch, 1791) Cheilinus lunulatus (Forsskål, 1775) Cheilinus oxycephalus Bleeker, 1853 Cheilinus trilobatus Lacépède, 1801 Che…

Measure of prices in different countries Purchasing power parity (PPP)[1] is a measure of the price of specific goods in different countries and is used to compare the absolute purchasing power of the countries' currencies. PPP is effectively the ratio of the price of a basket of goods at one location divided by the price of the basket of goods at a different location. The PPP inflation and exchange rate may differ from the market exchange rate because of tariffs, and other transaction c…

Cet article est une ébauche concernant le Luxembourg et le Concours Eurovision de la chanson. Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les recommandations des projets correspondants. Luxembourgau Concours Eurovision 1957 Données clés Pays  Luxembourg Chanson Amours mortes (tant de peine) Interprète Danièle Dupré Langue Français Sélection nationale Radiodiffuseur Télé Luxembourg Type de sélection Sélection interne Concours Eurovision de la …

Keuskupan OxfordCathedral Church of Christ, OxfordLokasiProvinsi gerejawiCanterburyKediakonan agungOxford, Buckingham, Berkshire, DorchesterStatistikParoki624Jemaat847InformasiKatedralChrist ChurchKepemimpinan kiniUskupSteven Croft, Uskup OxfordSufragan Colin Fletcher, Uskup Dorchester Alan Wilson, Uskup Buckingham Olivia Graham, Uskup Reading Diakon agung Martin Gorick, Deakon Agung Oxford dan Uskup-rancangan Dudley lowong, Deakon Agung Berkshire Judy French, Deakon Agung Dorchester Guy El…

Chinese satellite QueqiaoRendering of Queqiao satelliteMission typeCommunication relayRadio astronomyOperatorCNSACOSPAR ID2018-045A SATCAT no.43470Mission durationPlanned: 5 years5 years, 10 months, 15 days (in progress) Spacecraft propertiesBusCAST100[1]ManufacturerDFH Satellite Company LTDLaunch mass448.7 kilograms (989 lb)[1]Dry mass325 kilograms (717 lb)DimensionsSatellite: 1.4 × 1.4 × 0.85 m[1]Antenna: 4.2 metres (14 ft) in diameter …

41°36′7.54″N 71°22′3.73″W / 41.6020944°N 71.3677028°W / 41.6020944; -71.3677028 Hope Island Hope Island is a 91-acre (0.368 km2) island located in Narragansett Bay in the State of Rhode Island. It is part of the Narragansett Bay National Estuarine Research Reserve, along with nearby Prudence Island and Patience Island, and home to colonial wading birds during their nesting season of spring and summer. History The island was a gift from Narraganset chief M…

  المرصد الأوروبي الجنوبي المرصد الأوروبي الجنوبي‌ البلد ألمانيا  المقر الرئيسي غارشينغ باي مونشن  تاريخ التأسيس 1962 النوع منظمة أبحاث الفلك العضوية أرخايف[1]  المدير تيم دي زيو (سبتمبر 2007–أغسطس 2017)كاثرين كيسارسكي  [لغات أخرى]‏ (1999–2007)ريكاردو جياكوني (19…

Deadly blizzard in New York, United States, and Ontario, Canada Snow drifts made travel difficult in parts of New York (February 7, 1977) A house almost completely buried in snow in Tonawanda, New York (January 30, 1977) The blizzard of 1977 hit Western New York and Southern Ontario from January 28 to February 1 of that year. Daily peak wind gusts ranging from 46 to 69 mph (74 to 111 km/h) were recorded by the National Weather Service in Buffalo, with snowfall as high as 100 in (2…

American college basketball season 1986–87 Marist Red Foxes men's basketballECAC Metro regular season champions ECAC Metro tournament championsNCAA tournament, first roundConferenceEastern Collegiate Athletic Conference MetroRecord20–10 (15–1 ECACM)Head coachDave Magarity (1st season)Home arenaMcCann Recreation CenterSeasons← 1985–19861987–88 → 1986–87 ECAC Metro men's basketball standings vte Conf Overall Team W   L   PCT W   L   P…

Ministry of the Government of India Ministry of Ports, Shipping and WaterwaysBranch of Government of IndiaMinistry of Ports, Shipping and WaterwaysIndian PortAgency overviewJurisdictionGovernment of IndiaHeadquartersParivahan Bhavan1, Parliament StreetNew Delhi110001 28°37′9.58″N 77°12′37.29″E / 28.6193278°N 77.2103583°E / 28.6193278; 77.2103583Annual budget₹1,881.83 crore (US$240 million) (2018-19 est.) [1]Ministers responsibleSarbananda Sonowa…

Синелобый амазон Научная классификация Домен:ЭукариотыЦарство:ЖивотныеПодцарство:ЭуметазоиБез ранга:Двусторонне-симметричныеБез ранга:ВторичноротыеТип:ХордовыеПодтип:ПозвоночныеИнфратип:ЧелюстноротыеНадкласс:ЧетвероногиеКлада:АмниотыКлада:ЗавропсидыКласс:Птиц…

American college basketball season 1937–38 Illinois Fighting Illini men's basketballConferenceBig Ten ConferenceRecord9–9 (4-8 Big Ten)Head coachDouglas MillsAssistant coaches Howie Braun Wally RoettgerDavid M. Bullock (Trainer)[1] CaptainLou BoudreauHome arenaHuff HallSeasons← 1936–371938–39 → 1937–38 Big Ten Conference men's basketball standings vte Conf Overall Team W   L   PCT W   L   PCT Purdue 10 – 2   .833 18…

League of Ireland 2001-2002 Competizione League of Ireland Sport Calcio Edizione 81ª Organizzatore FAI Luogo  Irlanda Partecipanti 12 Cronologia della competizione 2000-01 2002-03 Manuale L'edizione 2001-2002 della League of Ireland Premier Division è stata vinta per la decima volta dallo Shelbourne.[1] Il campionato venne disputato da 12 squadre che si affrontarono 3 volte ciascuna, per un totale di 33 giornate. Indice 1 Classifica finale 1.1 Verdetti 1.1.1 La penalizzazione del …

Far Eastern Economic ReviewFar Eastern Economic Review, Edisi Terakhir, Desember 2009Mantan editorEric Halpern, Dick Wilson, Derek Davies, Philip BowringKategoriNewsmagazineFrekuensiWeekly, later monthlyPendiriEric HalpernDidirikan1946Terbitan terakhirDesember 2009Berpusat diHong KongBahasaInggrisISSN0014-7591 'The Far Eastern Economic Review' (bahasa Mandarin: 遠東經濟評論) (disingkat FEER) adalah sebuah majalah berita Asia berbahasa Inggris. Awalnya majalah bisnis yang berbasis di Hong K…

Koin-koin Nummi dari akhir masa pemerintahan Anastasius I: di bagian kiri sebuah koin 40-nummi (follis) dan di bagian kanan sebuah koin 5-nummi (pentanummium). Nummus: (Yunani: νουμμίον, noummion), jamak nummi (νοῦμμοι) adalah sebuah istilah Latin yang artinya koin, tetapi secara teknis digunakan oleh para penulis modern untuk serangkaian koin tembaga bernilai rendah yang dikeluarkan oleh kekaisaran Romawi dan Bizantium pada Zaman Kuno Akhir. Kata tersebut berasal dari kata Y…

Sporting event delegationTurkmenistan at the1996 Summer OlympicsIOC codeTKMNOCNational Olympic Committee of Turkmenistanin AtlantaCompetitors7 (4 men and 3 women) in 6 sportsFlag bearer Rozy RedzhepovMedals Gold 0 Silver 0 Bronze 0 Total 0 Summer Olympics appearances (overview)19962000200420082012201620202024Other related appearances Russian Empire (1900–1912) Soviet Union (1952–1988) Unified Team (1992) Turkmenistan competed in the Olympic Games as an independent nation …

City in FloridaLeesburg, FloridaCityCity of LeesburgLeesburg City HallMotto: The Lakefront CityLocation in Lake County and the state of FloridaCoordinates: 28°47′36″N 81°54′38″W / 28.79333°N 81.91056°W / 28.79333; -81.91056Country United States of AmericaState FloridaCounty LakeSettled (Leesburg)1857[1]Incorporated (city)July 12, 1875[1]Government • TypeCommission–Manager • MayorJimmy Burry • …

Air 1 radio station in Cherry Hill, New Jersey This article needs additional citations for verification. Please help improve this article by adding citations to reliable sources. Unsourced material may be challenged and removed.Find sources: WYPA – news · newspapers · books · scholar · JSTOR (April 2017) (Learn how and when to remove this message) WYPACherry Hill, New JerseyBroadcast areaPhiladelphia/Cherry HillFrequency89.5 MHz (HD Radio)BrandingAir1Prog…

Cargo and passenger ship SS Shuntien in civilian service, 1934–41 The icebreaker shape of her bow is clearly visible Photograph reproduced courtesy of WikiSwire History Hong Kong NameShuntien NamesakeShuntian, a Ming Dynasty name for Beijing Owner China Navigation Co, Ltd[1][2] Operator John Swire & Sons, Ltd Port of registry London[1] RouteShanghai – Tianjin coastal service[4] BuilderTaikoo Dockyard & Engineering Co[1][6] Yard number26…

Kembali kehalaman sebelumnya