يتكون العلم من ثلاث ألوان وهي من أعلى لأسفل اللون الأسود ثم اللون الأبيض ثم اللون الأخضر، وأيضا مثلث متساوي الساقين أحمر اللون، ولكل لون في العلم دلالة مميزة له وهي كالتالي:
اللون الأسود: للدلالة عما تمر به «دولة الشعب الصحراوي» من ظلم واضطهاد تحت وطأة «الاحتلال المغربي» حسب تعبيرهم.
اللون الأبيض: يشير اللون الأبيض للسلام والأخوة، كما يشير إلى أن الشعب الصحراوي شعب طيب ويرغب فقط في السلام والعيش بحرية في أرضه.
اللون الأخضر: يشير هذا اللون للأمل في غد أفضل تخضر فيه الأرض، وتشير أيضا للمشروع الوطني الذي يهدف للنماء.
اللون الأحمر: يشير إلى دماء الشهداء والتي روت أرض الوطن «الصحراوي».