لعب فاروق هادزيبيغيتش خلال مسيرته الاحترافية مع 4 أندية في تسعة عشر موسمًا وسجل خلالها 48 هدفًا ضمن 566 مباراة. ولم يفز بأي موسم بالكأس وفاز في موسم واحد بالدوري.
خاض فاروق هادزيبيغيتش مسيرته مع نادي ساراييفو في موسم 1976–77 ليلعب معه تسعة مواسم، مشاركًا في 241 مباراة سجل خلالها 25 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي ريال بيتيس في موسم 1985–86 ولمدة موسمين، حيث شارك في 75 مباراة سجل خلالها 8 أهداف. لينتقل بعدها إلى نادي سوشو في موسم 1987–88 ليلعب معه سبعة مواسم، مشاركًا في 242 مباراة سجل خلالها 15 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي تولوز في موسم 1994–95 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 8 مباريات ولم يسجل أي هدف.[4]