مرحلة خروج المغلوب في كأس الاتحاد الآسيوي 2012 تتكون من 16 فريق (8 من منطقة غرب آسيا و 8 من شرق آسيا). والفرق الستة عشر تشمل فائزي وثواني المجموعات الثمانية من دور المجموعات.
كل دور يلعب بنظام مسابقة إخراج المغلوب على مباراة ومباراتين. وفي دور الـ16 تقام كل مواجهة من مباراة واحدة على أرض الفريق الذي يتصدر مجموعته في الدور الأول. في ربع النهائي ونصف النهائي، ستلعب كل مواجهة بنظام الذهاب والإياب. وسوف يستضيف النهائي أحد الفريقين الذين تأهلوا له، يحدد في القرعة. قانون الأهداف خارج القواعد سيطبق (لمواجهات الذهاب والإياب)، أما الوقت الإضافيوركلات الترجيح ستستخدم لتحديد الفائز إذا كان ينبغي.[1]
تم تحديد جدول المباريات لدور الستة عشر استناداً لنتائج دور المجموعات.[2] أقيمت قرعة ربع النهائي، نصف النهائي، والنهائي بعد الانتهاء من دور الستة عشر بمقر الاتحاد الآسيوي في كوالا لمبور، ماليزيا يوم 14 يونيو 2012، 15:00 ت ع م+08:00.[3] في هذه القرعة سيتم تطبيق قانون يقضي بعدم وضع ناديين من نفس البلد في نفس المواجهة في ربع النهائي؛ ولكن، إذا كان يوجد أكثر من ناديين من نفس البلد، ممكن مواجهة بعضهم البعض.
