|
تكرارية W-D الأربعينية
| WD domain, G-beta repeat
|
|
| مبيان شريط of the C-terminal WD40 domain of Tup1 (a transcriptional corepressor in yeast), which adopts a 7-bladed beta-propeller fold. Ribbon is colored from blue (نهاية أمينية) to red (نهاية كربوكسيلية).[1]
|
| معرف
|
| رمز
|
WD40
|
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات
|
PF00400
|
| قاعدة بيانات عوائل البروتينات clan
|
CL0186
|
| إنتربرو
|
IPR001680
|
| بروسايت
|
PDOC00574
|
| قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
|
1gp2
|
| تراكيب PDB المتوفرة:
|
| 1b9x, 1b9y, 1erj, 1gg2, 1got, 1gp2, 1gxr, 1nex, 1nr0, 1omw, 1p22, 1pev, 1pgu, 1pi6, 1s4u, 1sq9, 1tbg, 1u4c, 1xhm, 1yfq, 2bcj, 2ce8, 2ce9, 2trc
|
|
تكرارية W-D الأربعينية (أو WD أو تكرارية WD40 أو تكرارية β-ترانسدُسين) هي طابع بِنيَوي قصير مبني على حوالي 40 حمضًا أمينيًّا، وينتهي عادة بثنائية التربتوفان-حمض الأسبارتيك (W-D).[2] تُطوى النسخ الترادفية لهذه التكراريات عادة معًا لتشكل نطاقًا دائريًّا لولبيًّا بروتينيًّا يسمى نطاق W-D الأربعيني.
البنية
البروتينات الحاوية على نطاق W-D الأربعيني تتضمن من 4 إلى 16 وحدة متكررة، يُعتقد أن كلها تشكل بنية مروحية بائية (لاحظ الشكل على اليسار).[3][4] يحوي نطاق W-D الأربعيني عددًا من التكراريات، منطقة متغيرة تحتوي في بدايتها على حوالي 20 بقية تليها مجموعة بقيات متكررة أكثر شيوعًا. تشكل هذه التكراريات عادة أربع صحف بائية عكسية التوازي (يُشار إليها بالشفرات). تجتمع هذه الشفرات مُشكِّلةً مراوح أكثرها شيوعا هي المراوح البائية سُباعية الشفرات. تتشابك تلك الشفرات بحيث تشكل آخر سلسلة بائية في تكرارية بنية شفرة ثلاثية الأبعاد مع السلاسل الثلاث الأولى في التكرارية التي تليها.
الوظيفة
بروتينات تكرارية WD40 تشكل عائلة شاسعة تتواجد في كل حقيقيات النوى وتتدخل في وظائف متنوعة كتنبيغ الإشارات ، تنظيم النسخ، التحكم في الدورة الخلوية، وحتى الالتهام الذاتي والاستماتة.[5] الوظيفة المشتركة بين كل بروتينات تكرارية WD40 هي تنسيق مُجمَّعات مُركَّبة متعددة البروتينات، حيث تعمل الوحدات المتكررة كسقالة للتآثرات البروتينية. يُحدَّد اختصاص البروتين بالتسلسلات خارج التكراريات نفسِها. من الأمثلة على هذه المُركَّبات توجد بروتينات G (فوحداتها الفرعية البائية بمثابة مروحية بائية)، عامل نسخ TAFII، وليغاز اليوبيكويتين E3.[3][4]
الأمثلة
وفقًا للتحليل الأولي للمجموع المورثي البشري، فإن تكرارية W-D الأربعينية هي ثامن أكبر عائلة بروتينات. تُعرِّف على 277 بروتينًا يحتويها.[6] منَ المورثات البشرية التي تشفر بروتينات تحتوي على هذا النطاق ما يلي:
- AAAS، AAMP، AHI1، AMBRA1، APAF1، ARPC1A، ARPC1B، ATG16L1,
- BOP1، BRWD1، BRWD3، BTRC، BUB3,
- C6orf11، CDC20، CDC40، CDRT1، CHAF1B، CIAO1، CIRH1A، COPA، COPB2، CORO1A، CORO1B، CORO1C، CORO2A، CORO2B، CORO6، CORO7، CSTF1,
- DDB2، DENND3، DMWD، DMXL1، DMXL2، DNAI1، DNAI2، DNCI1، DTL، DYNC1I1، DYNC1I2، EDC4,
- EED، EIF3S2، ELP2، EML1، EML2، EML3، EML4، EML4-ALK، EML5، ERCC8,
- FBXW10، FBXW11، FBXW2، FBXW4، FBXW5، FBXW7، FBXW8، FBXW9، FZR1,
- GBL, GEMIN5، GNB1، GNB1L، GNB2، GNB2L1، GNB3، GNB4، GNB5، GRWD1، GTF3C2,
- HERC1، HIRA، HZGJ,
- IFT121، IFT122، IFT140، IFT172، IFT80، IQWD1,
- KATNB1، KIAA1336، KIF21A، KIF21B، KM-PA-2,
- KEAP1,
- LLGL1، LLGL2، LRBA، LRRK1، LRRK2، LRWD1، LYST,
- MAPKBP1، MED16، MORG1,
- NBEA، NBEAL1، NEDD1، NLE1، NSMAF، NUP37، NUP43، NWD1,
- PAAF1، PAFAH1B1، PAK1IP1، PEX7، PHIP، PIK3R4، PLAA، PLRG1، PPP2R2A، PPP2R2B، PPP2R2C، PPP2R2D، PPWD1، PREB، PRPF19، PRPF4، PWP1، PWP2,
- RAE1، RPTOR، RBBP4، RBBP5، RBBP7، RFWD2، RFWD3، RRP9,
- SCAP، SEC13، SEC31A، SEC31B، SEH1L، SHKBP1، SMU1، SPAG16, SPG, STRAP، STRN، STRN3، STRN4، STXBP5، STXBP5L,
- TAF5، TAF5L، TBL1X، TBL1XR1، TBL1Y، TBL2، TBL3، TEP1، THOC3، THOC6، TLE1، TLE2، TLE3، TLE4، TLE6، TRAF7، TSSC1، TULP4، TUWD12,
- UTP15، UTP18,
- WAIT1، WDF3، WDFY1، WDFY2، WDFY3، WDFY4، WDHD1، WDR1، WDR10، WDR11، WDR12، WDR13، WDR16، WDR17، WDR18، WDR19، WDR20، WDR21A، WDR21C، WDR22، WDR23، WDR24، WDR25، WDR26، WDR27، WDR3، WDR31، WDR32، WDR33، WDR34، WDR35، WDR36، WDR37، WDR38، WDR4، WDR40A، WDR40B، WDR40C، WDR41، WDR42A، WDR42B، WDR43، WDR44، WDR46، WDR47، WDR48، WDR49، WDR5، WDR51A، WDR51B، WDR52، WDR53، WDR54، WDR55، WDR57، WDR59، WDR5B، WDR6، WDR60، WDR61، WDR62، WDR63، WDR64، WDR65، WDR66، WDR67، WDR68، WDR69، WDR7، WDR70، WDR72، WDR73، WDR74، WDR75، WDR76، WDR77، WDR78، WDR79، WDR8، WDR81، WDR82، WDR85، WDR86، WDR88، WDR89، WDR90، WDR91، WDR92، WDSOF1، WDSUB1، WDTC1، WSB1، WSB2,
- ZFP106
مراجع
|
|
