أقيمت السفارة السورية في ألمانيا الاتحادية لأول مرة عام 1953 العاصمة بون في شارع Kronprinzenstraße 2 وذلك حتى العام 1990 حيث تم نقل السفارة إلى شاريعAndreas-Hermes-Straße 5. بدأت العلاقات الدبلوماسية مع ألمانيا الشرقية عام 1969 وكان مقر السفارة في شارع Otto-Grotewohl-Straße 3a (حالياَ تسمى: Wilhelmstraße 66) في وسط-برلين.
قامت ألمانيا بطرد السفير السوري في أيار 2012 وقامت بطرد باقي أعضاء السفارة الأربع لاحقاً من ذات السنة.[5]