أسس المعهد رئيس الأساقفة خوسيه هيبوليتو سالاس، بموافقة شخصية من بيوس التاسع. وكان يعرف في البداية باسم سان سيباستيان في يومبل الذي ظهر في السجلات العامة حتى عام 1905.[2]
تأسست المدرسة على أساس الصلاة الكاثوليكية والمناقشة اللاهوتية، والتي لا تزال مهمة للممارسات والاحتفالات المدرسية.[2]
خضعت المدرسة لتجديد واسع النطاق في أواخر عام 2007 ، بما في ذلك جناح جديد، والفصول الدراسية، والمراحيض، والاستحمام، ومختبر الكمبيوتر. كانت التجديدات، التي تديرها المؤسسة التعليمية كريستو ري، نجاحًا كبيرً[2]ا.
مرافق معهد سان سيباستيان في يومبل ، المقابلة للمدرسة الثانوية ، أمام الساحة الرئيسية في يومبل.
