Die Categoría Primera B 2009, nach einem Sponsor offiziell Copa Premier genannt, war die zwanzigste Spielzeit der zweiten kolumbianischen Spielklasse im Fußball der Herren, die aus Apertura und Finalización bestand. Sie begann am 31. Januar 2009 und endete am 29. November. Vorjahresmeister war Real Cartagena. Absteiger aus der ersten Liga war Atlético Bucaramanga.
In Apertura und Finalización wurden zunächst alle Mannschaften in zwei Gruppen mit je neun Mannschaften gelost. In jeder Gruppe spielten alle Mannschaften im Ligamodus zweimal gegeneinander, zusätzlich spielte jede Mannschaft gegen ein Team aus der anderen Gruppe. In jeder Gruppe qualifizierten sich die ersten vier Mannschaften für die Finalrunde, die aus zwei Gruppen mit jeweils vier Mannschaften bestand. Die beiden Gruppensieger spielten jeweils einen Halbserienmeister aus.
Die beiden Halbserienmeister qualifizierten sich für das Finale, in der der Meister und direkte Aufsteiger ermittelt wurde. Der Vizemeister spielte eine Relegation gegen den Vorletzten der ersten Liga. Absteiger aus der zweiten Liga gab es nicht.
