Nanoarchaeota

Nanoarchaeales
Ignicoccus hospitalis mit angehefteten Nanoarchaeum equitans
Systematik
Domäne: Archaea Überstamm: DPANN ohne Rang: DPANN Cluster 2[1] Stamm: Nanoarchaeota Klasse: Nanoarchaeia Ordnung: Nanoarchaeales
Wissenschaftlicher Name des Stamms
Nanoarchaeota
Huber et al. 2011
Wissenschaftlicher Name der Ordnung
Nanoarchaeales
Huber et al. 2011

Nanoarchaeota^[2] ist ein Phylum (Stamm) von Archaeen, der meist als zur Gruppe der DPANN-Archaea gehörig angesehen wird.^[3][4] Die erste entdeckte Art dieser Gruppe ist Nanoarchaeum equitans, entdeckt von Huber et al. 2002 in einer Hydrothermalquelle nahe der Küste Islands.^[5] Im Jahr 2013 erschien einen Bericht über die Entdeckung einer zweiten Vertreters der Nanoarcheota, Nanobsidianus stetteri.^[6][7] Es handelt sich um Symbionten (oder auch Parasiten) anderer Archaeen.^[8] Mitglieder der Nanoarchaeota sind Ektosymbionten verschiedener Crenarchaeota wie z. B. Acidilobus sp. 7A,^[9] Sulfolobales archaeon Acd1^[10] und Ignicoccus hospitalis.^[1]

Ihr Status als einziges Mitglied eines eigenen Phylums ist jedoch umstritten, da es sich tatsächlich um eine hochspezialisierte Gruppe handeln könnte, die aus der Ordnung Thermococcales innerhalb der Euryarchaeota hervorgegangen ist.^[11][5][12]

Eine erste Prüfung der 16S-rRNA-Sequenz von Nanoarchaeum equitans zeigte zwar eine höchstwahrscheinliche Zugehörigkeit zu den Archaeen an. Die Unterschiede dieser Sequenz mit denen der Euryarchaeota und Crenarchaeota sind aber etwa gleich groß wie der Unterschied zwischen diesen beiden Gruppen. Daher hatte man dieser Spezies ein eigenes neues Phylum, Nanoarchaeota, zugewiesen. Ein späterer Vergleich anderer Gensequenzen, die nicht für ribosomale RNA (rRNA) stehen, deutete aber darauf hin, dass Nanoarchaeum equitans (und damit die Gruppe der Nanoarchaeota) möglicherweise doch zu den Euryarchaeota gehört.^{[11][5][12][8]} Einzelne unten aufgeführte Mitglieder werden teilweise allerdings davon abweichend auch zu den Thermoprotei (Crenarchaeota) gestellt.^[3]

Die Bezeichnung „Nanoarchaeota“ leitet sich ab von altgriechisch νᾶνος nános, deutsch ‚Zwerg‘, ‚Winzling‘ (vgl. Nanometer), der Mittelteil verweist auf Organismen aus der Domäne der Archaeen, der Suffix ‚-ota‘ bezeichnet Phyla (Abteilungen/Stämme).^[3] Die erste bekannte Gattung dieses Phylums ist Nanoarchaeum mit Nanoarchaeum equitans.^[3]

Die gegenwärtig (Stand Februar 2022) akzeptierte Taxonomie basiert im Wesentlichen auf folgenden Quellen:

• L – List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[3]
• N – National Center for Biotechnology Information (NCBI, Taxonomy Browser),^[4]

Diese sieht die Nanoarchaeota zusammen mit den Parvarchaeota (beides Mitglieder der heute als paraphyletisch angesehenen ARMAN-Gruppe) als Mitglieder der DPANN-Archaeen.^[13] Vertreter in doppelten Anführungszeichen sind noch nicht vollgültig taxonomisch beschrieben:

Phylum: „Nanoarchaeota“ Huber et al. 2002 (L,N)

• Klasse „Candidatus Nanoarchaeia“ Vázquez-Campos et al. 2021 (L,N)
  • Ordnung „Nanoarchaeales“ Huber et al. 2011 (L,N) – laut LPSN nicht der Klassen Nanoarchaeia zugeordnet
    • Familie „Nanoarchaeaceae“ Huber et al. 2011 (L,N)
      • Gattung „Nanoarchaeum“ Huber et al. 2002 (L,N), früher auch „Microarchaeum“ (N)
        • Spezies „Nanoarchaeum equitans“ Huber et al. 2002 (L,N)
        • Stämme, die mögliche weitere Spezies der Gattung „Nanoarchaeum“ darstellen.^[14]
    • Familie „Nanopusillaceae“ Huber et al. 2011 (N)^[15]
      – laut LPSN gehören die Mitglieder zu verschiedenen Ordnungen der Thermoprotei^[11]
      • Gattung „Candidatus Nanobsidianus“ Castelle et al. 2015 (L,N)
        – laut LPSN zur Ordnung Sulfolobales (Thermoprotei)
        • Spezies „Candidatus Nanobsidianus stetteri“ Castelle et al. 2015 (L,N) bzw. Munson-McGee et al. 2015, inkl. Candidatus Nanopusillus sp. Nst1 (N)^[6][7]
      • Gattung „Candidatus Nanopusillus“ Wurch et al. 2016 (N)
        • Spezies „Candidatus Nanopusillus acidilobi“ Wurch et al. 2016 (L,N) inkl. Nanoarchaeota archaeon 7A (N)
          – laut LPSN zur Familie Desulfurococcaceae (Ordnung Desulfurococcales der Thermoprotei)
        • Spezies Candidatus Nanopusillus sp. CESUR00123 (N)
        • Spezies Candidatus Nanopusillus sp. Marseille-Q6268 (N)
  • Ordnung „Candidatus Tiddalikarchaeales“ Vázquez-Campos et al. 2021 (L,N)
    • Familie „Candidatus Tiddalikarchaeaceae“ Vázquez-Campos et al. 2021 (L,N)
      • Gattung „Candidatus Tiddalikarchaeum“ Vázquez-Campos et al. 2021 (L,N)
        • Spezies „Candidatus Tiddalikarchaeum anstoanum“ Vázquez-Campos et al. 2021 (L,N)
• Gattungen innerhalb der „Nanoarchaeota“ ohne Familien-, Ordnungs- oder Klassenzuweisung

  • Gattung „Candidatus Nanoclepta“ St. Johns et al. 2019 (N)
    • Spezies „Candidatus Nanoclepta minuta“ St. Johns et al. 2019 (N)

• Stämme, die mögliche weitere Spezies des Phylums „Nanoarchaeota“ darstellen.^[16] Beispiel:

  • Spezies Nanoarchaeota archaeon Gua-46 (N) – Guaymas-Becken, Golf von Kalifornien (N)^[17]

Seit der Entdeckung der Nanoarchaeota haben sich viele Hinweise darauf angesammelt, dass diese Archaeen neben hydrothermalen Meeresquellen verschiedene weitere Lebensräume bewohnen. Bei der Untersuchung von Primern für das 16S-rRNA-Gen von N. equitans wurde gezeigt, dass diese Art in terrestrischen Thermalquellen sowie in mesophilen Lebensräumen mit erhöhtem Salzgehalt weit verbreitet ist. rRNA-Gensequenzen von N. equitans wurden auch in Wasserproben aus der euphotischen Zone auch in beträchtlicher Entfernung von Hydrothermalquellen gefunden. Offenbar leben Nanoarchaeota bei unterschiedlichen Temperaturen und in geochemisch unterschiedlichen Umgebungen.^[7]

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• PubMed references for Nanoarchaeota
• PubMed Central references for Nanoarchaeota
• Google Scholar references for Nanoarchaeota

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• OneZoom: Nanoarchaeota
• Search results: Nanoarchaeota, auf MicrobeWiki, Kenyon College, Department of Biology.
• LPSN: Phylum "Candidatus Nanoarchaeota" Huber et al. 2002

1. ↑ ^{a b} Nina Dombrowski, Tom A. Williams, Jiarui Sun, Benjamin J. Woodcroft, Jun-Hoe Lee, Bui Quang Minh, Christian Rinke, Anja Spang: Undinarchaeota illuminate DPANN phylogeny and the impact of gene transfer on archaeal evolution. In: Nature Communications, Band 11, Nr. 3939, 7. August 2020; doi:10.1038/s41467-020-17408-w (englisch).
2. ↑ OneZoom: Nanoarchaeota
3. ↑ ^{a b c d e} LPSN: Phylum "Candidatus Nanoarchaeota" Huber et al. 2002
4. ↑ ^{a b} NCBI Nanoarchaeota. Data extracted from the NCBI taxonomy resources. National Center for Biotechnology Information; abgerufen im 1. Januar 1 
5. ↑ ^{a b c} Harald Huber, Michael J. Hohn, Reinhard Rachel, Tanja Fuchs, Verena C. Wimmer, Karl O. Stetter: A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont. In: Nature. 417. Jahrgang, Nr. 6884, 2. Mai 2002, S. 63–67, doi:10.1038/417063a, PMID 11986665, bibcode:2002Natur.417...63H. 
6. ↑ ^{a b} Mircea Podar, Kira S. Makarova, David E. Graham, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Anna-Louise Reysenbach: Insights into archaeal evolution and symbiosis from the genomes of a nanoarchaeon and its inferred crenarchaeal host from Obsidian Pool, Yellowstone National Park. In: Biol Direct, Band 8, Nr. 9, 22. April 2013; doi:10.1186/1745-6150-8-9, PMID 23607440, PMC 3655853 (freier Volltext).
7. ↑ ^{a b c} Jacob H. Munson-McGee, Erin K. Field, Mary Bateson, Colleen Rooney, Ramunas Stepanauskas, Mark J. Young: Nanoarchaeota, Their Sulfolobales Host, and Nanoarchaeota Virus Distribution across Yellowstone National Park Hot Springs. In: ASM Appl Environ Microbiol, Band 81, Nr. 22, November 2015; doi:10.1128/AEM.01539-15, PMID 26341207, PMC 4616950 (freier Volltext), Epub 4. September 2015.
8. ↑ ^{a b} Elizabeth Waters, Michael J. Hohn, Ivan Ahel, David E. Graham, Mark D. Adams, Mary Barnstead, Karen Y. Beeson, Lisa Bibbs, Randall Bolanos, Martin Keller, Keith Kretz, Xiaoying Lin, Eric Mathur, Jingwei Ni, Mircea Podar, Toby Richardson, Granger G. Sutton, Melvin Simon, Dieter Söll, Karl O. Stetter, Jay M. Short, Michiel Noordewier: The genome of Nanoarchaeum equitans: Insights into early archaeal evolution and derived parasitism. In: PNAS, Band 100, Nr. 22, 28. Oktober 2003, S. 12984​-12988; doi:10.1073/pnas.1735403100, PMID 14566062, PMC 240731 (freier Volltext).
9. ↑ NCBI Acidilobus sp. 7A (species)
10. ↑ NCBI Sulfolobales archaeon Acd1 (species)
11. ↑ ^{a b c} Celine Brochier, Simonetta Gribaldo, Yvan Zivanovic, Fabrice Confalonieri, Patrick Forterre: Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales? In: Genome Biology, Band 6, Nr. R42, 14. April 2005; doi:10.1186/gb-2005-6-5-r42, PMID 15892870, PMC 1175954 (freier Volltext).
12. ↑ ^{a b} Michael J. Hohn, Brian P. Hedlund, Harald Huber: Detection of 16S rDNA sequences representing the novel phylum "Nanoarchaeota": indication for a wide distribution in high temperature biotopes. In: Syst. Appl. Microbiol. 25. Jahrgang, Nr. 4, Dezember 2002, S. 551–554, doi:10.1078/07232020260517698, PMID 12583716. 
13. ↑ Cindy J. Castelle, Kelly C. Wrighton, Brian C. Thomas, Laura A. Hug, Christopher T. Brown, Michael J. Wilkins, Kyle R. Frischkorn, Susannah G. Tringe, Andrea Singh, Lye Meng Markillie, Ronald C. Taylor, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield: Genomic Expansion of Domain Archaea Highlights Roles for Organisms from New Phyla in Anaerobic Carbon Cycling. In: Current Biology. 25. Jahrgang, 19. Februar 2015, S. 690–701, doi:10.1016/j.cub.2015.01.014, PMID 25702576 (cell.com). 
14. ↑ NCBI unclassified Nanoarchaeum (Liste)
15. ↑ Joshua N. Hamm, Susanne Erdmann, Emiley A. Eloe-Fadrosh, Allegra Angeloni, Ling Zhong, Christopher Brownlee, Timothy J. Williams, Kirston Barton, Shaun Carswell, Martin A. Smith, Sarah Brazendale, Alyce M. Hancock, Michelle A. Allen, Mark J. Raftery; Norman R. Pace (Hrsg.): Unexpected host dependency of Antarctic Nanohaloarchaeota, in: PNAS, Band 116, Nr. 29, Juni/Juli 2019, S. 14661​-14670; doi:10.1073/pnas.1905179116, PMID 31253704.
16. ↑ NCBI unclassified Nanoarchaeota (Liste)
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