Grab von Marheineke auf dem Dreifaltigkeitskirchhof II in Berlin-Kreuzberg
Marheineke gilt dank seiner Werke System des Katholizismus in seiner symbolischen Entwickelung (1810–1813) und Christliche Symbolik (1810) als einer der Wegbereiter der wissenschaftlichen Konfessionskunde. Auch in der Praktischen Theologie wird er zu den Begründer des Faches gezählt. Viele seiner Werke behandeln kirchengeschichtliche Themen, unter denen die Universalhistorie des Christentums (1806) und die Geschichte der deutschen Reformation (1816/17) hervorzuheben sind. Besondere Beachtung fanden jedoch seine Schriften zur Dogmatik, die anfangs (Grundlehren der christlichen Dogmatik, 1819) stark unter Schellings Einfluss, später (Grundlehren der Dogmatik als Wissenschaft, 1827; Vorlesungen über das System der christlichen Dogmatik, postum 1847) unter dem Hegels standen.
Grundlegung der Homiletik. In einigen Vorlesungen über den wahren Charakter eines protestantischen Geistlichen. Perthes, Hamburg 1811. (Digitalisat)
Grundlehren der Dogmatik. Berlin 1819
Institutiones symbolicae, doctrinarum omnium societatum Christianarum summam et discrimina exhibens. Voss, Berlin 1825. (Digitalisat) (3. Aufl. 1830)
Über die wahre Stellung des liturgischen Rechts im evangelischen Kirchenregiment. Cawitzel, Berlin 1825.
Entwurf der practischen Theologie. Duncker & Humblot, Berlin 1837
Das Gebet des Herrn in dreizehn Predigten. Nebst den am dreihundert Jährigen Jubelfest der Einführung der Reformation in die Mark Brandenburg im Jahr 1839, und am Gedächtnisstage der Verstorbenen im Jahr 1839 gehaltenen. Duncker & Humblot, Berlin 1848.
Zur Kritik der Schellingschen Offenbarungsphilosophie. Schluß der öffentlichen Vorlesungen über die Bedeutung der Hegelschen Philosophie in der christlichen Theologie. Ensslin, Berlin 1843. (Digitalisat)
Die Reformation, dem deutschen Volk erzählt. Klemann, Berlin 1846
Vorlesungen über die christliche Moral, Dogmatik, Symbolik und Dogmengeschichte. Duncker & Humblot, Berlin 1847–1849 (4 Bde.)
Predigten, der häuslichen Frömmigkeit gewidmet. Duncker & Humblot, Berlin 1826.
Band 1: Die Leidensgeschichte des Herrn in einer Reihe von Fastenpredigten
Eva-Maria Rupprecht: Kritikvergessene Spekulation. Das Religions- und Theologieverständnis der spekulativen Theologie Ph. K. Marheinekes (= Beiträge zur rationalen Theologie 3). Peter Lang, Frankfurt a. M. u. a. 1993.
Luís Henrique Dreher: Metaphors of light: Philipp K. Marheineke's method and the ongoing program of mediation theology. Peter Lang, Frankfurt a. M. u. a. 1998.
Albrecht Titus Wolff: Spekulative Ekklesiologie. Das Verständnis der Kirche in der Dogmatik von Philipp Konrad Marheineke. Peter Lang, Frankfurt a. M. u. a. 1998.