Share to: share facebook share twitter share wa share telegram print page

Avian HBV RNA encapsidation signal epsilon

Fig. 1. Duck HBV RNA encapsidation signal epsilon
Fig. 2. Heron HBV RNA encapsidation signal epsilon
AHBV_epsilon cis-regulatory RNA element
Predicted secondary structure and sequence conservation of AHBV_epsilon
Identifiers
SymbolAHBV_epsilon
RfamRF01313
Other data
RNA typeCis-reg
Domain(s)Viruses
GOGO:0019079
SOSO:0005836
PDB structuresPDBe

The Avian HBV RNA encapsidation signal epsilon (AHBV epsilon[1]) is an RNA structure that is shown to facilitate encapsidation of the pregenomic RNA required for viral replication. There are two main classes of encapsidation signals in avian hepatitis B viruses - Duck hepatitis B virus (DHBV) and Heron hepatitis B virus (HHBV) like. DHBV is used as a model to understand human Hepatitis B virus. Although studies have shown that the HHBV epsilon has less pairing in the upper stem than DHBV, this pairing is not absolutely required for DHBV infection in ducks.[2]

DHBV epsilon consists of a stem structure, a bulge and an apical loop (Fig. 1). The RNA structure was determined by chemical probing, NMR analysis and by mutagenesis.[3]

HHBV epsilon also consists of a stem structure, a bulge and an apical loop (Fig. 2). The RNA structure has been determined by chemical probing and by mutagenesis. However, it has less base pairing in the upper stem than DHBV epsilon. [4]

Recent NMR analysis of both the HHBV and DHBV epsilon have shown that the apical loop to be capped by a stable well-structured UGUU tetraloop.[5]

In the Rfam database a single covariation model (AHBV_epsilon box right) best discriminates between the true instances of the element in sequence databases and background. The secondary structure diagram is a computer generated view of the structure with highly conserved bases shown in red. It includes the major elements shown in Figures 1 and 2.[citation needed]

See also

References

  1. ^ "Rfam: Family: AHBV_epsilon (RF01313)".
  2. ^ Schmid B, Rösler C, Nassal M (September 2011). "A high level of mutation tolerance in the multifunctional sequence encoding the RNA encapsidation signal of an avian hepatitis B virus and slow evolution rate revealed by in vivo infection". Journal of Virology. 85 (18): 9300–9313. doi:10.1128/JVI.05005-11. PMC 3165760. PMID 21752921.
  3. ^ Smith GJ, Donello JE, Lück R, Steger G, Hope TJ (November 1998). "The hepatitis B virus post-transcriptional regulatory element contains two conserved RNA stem-loops which are required for function". Nucleic Acids Research. 26 (21): 4818–4827. doi:10.1093/nar/26.21.4818. PMC 147918. PMID 9776740.
  4. ^ Beck J, Nassal M (July 1997). "Sequence- and structure-specific determinants in the interaction between the RNA encapsidation signal and reverse transcriptase of avian hepatitis B viruses". Journal of Virology. 71 (7): 4971–4980. doi:10.1128/JVI.71.7.4971-4980.1997. PMC 191728. PMID 9188560.
  5. ^ Girard FC, Ottink OM, Ampt KA, Tessari M, Wijmenga SS (2007). "Thermodynamics and NMR studies on Duck, Heron and Human HBV encapsidation signals". Nucleic Acids Research. 35 (8): 2800–2811. doi:10.1093/nar/gkm131. PMC 1885660. PMID 17430968.

External links

Read more information:

GAYLEGayle, 2022LahirTaylor Gayle Rutherford8 Juli 2004 (umur 19)Dallas, Texas, A.S.PekerjaanPenyanyi-penulis laguTahun aktif2020–sekarangKarier musikGenre Pop pop rock pop-punk power pop Instrumen Vokal gitar Label Atlantic Arthouse Situs webgayleofficial.com Taylor Gayle Rutherford (lahir 8 Juli 2004), dikenal secara luas dengan nama Gayle, adalah seorang penyanyi-penulis lagu berkebangsaan Amerika. Setelah menandatangani kontrak dengan Atlantic Records, ia merilis single ABCDEFU p…

Atletik padaPekan Olahraga Nasional 2016 Lintasan 100 m putra putri 200 m putra putri 400 m putra putri 800 m putra putri 1500 m putra putri 5000 m putra putri 10.000 m putra putri 100 m gawang putri 110 m gawang putra 400 m gawang putra putri 3000 m h'rintang putra putri 10.000 m jalan cepat putra 4×100 m estafet putra putri 4×400 m estafet putra putri Jalan raya Maraton putra putri 20 km jalan cepat putra putri Lapangan Lompat tinggi putra putri Lompat galah putra putri Lompat jauh putra put…

Artikel ini sebatang kara, artinya tidak ada artikel lain yang memiliki pranala balik ke halaman ini.Bantulah menambah pranala ke artikel ini dari artikel yang berhubungan atau coba peralatan pencari pranala.Tag ini diberikan pada Mei 2016. Andi Siti Nurhani Sapada (25 Juni 1929 – 8 Juli 2010) adalah seniman berkebangsaan Indonesia. Namanya dikenal secara luas melalui karya-karyanya berupa ciptaan tari-tarian. Dia merupakan salah satu penari Istana Negara semasa pemerintahan Pres…

Sumber referensi dari artikel ini belum dipastikan dan mungkin isinya tidak benar. Mohon periksa, kembangkan artikel ini, dan tambahkan sumber yang benar pada bagian yang diperlukan. (Pelajari cara dan kapan saatnya untuk menghapus pesan templat ini) artikel ini perlu dirapikan agar memenuhi standar Wikipedia. Tidak ada alasan yang diberikan. Silakan kembangkan artikel ini semampu Anda. Merapikan artikel dapat dilakukan dengan wikifikasi atau membagi artikel ke paragraf-paragraf. Jika sudah dira…

  لمعانٍ أخرى، طالع ترينيتي (توضيح).   ميّز عن ثالوث. ترينيتي الانفجار الذي خلفه ترينيتي بعد 16 ميليثانية من التفجير. البلد الولايات المتحدة موقع الاختبار موقع ترينيتي، نيو مكسيكو إحداثيات 33°40′31″N 106°28′29″W / 33.6753°N 106.4747°W / 33.6753; -106.4747[1]  التاريخ 16 ي…

Swedish ice hockey player (born 1971) Sundin redirects here. For the surname, see Sundin (surname). Ice hockey player Mats Sundin Hockey Hall of Fame, 2012 Sundin in 2015Born (1971-02-13) 13 February 1971 (age 53)Bromma, SwedenHeight 6 ft 5 in (196 cm)Weight 240 lb (109 kg; 17 st 2 lb)Position CentreShot RightPlayed for Djurgårdens IFQuebec NordiquesToronto Maple LeafsVancouver CanucksNational team  SwedenNHL Draft 1st overall, 1989Quebec NordiquesPl…

Platyhelminthes TaksonomiSuperkerajaanEukaryotaKerajaanAnimaliaSuperfilumSpiraliaFilumPlatyhelminthes Gegenbaur, 1859 Kelas Turbellaria Trematoda Cestoda Monogenea lbs Platyhelminthes adalah filum dalam Kerajaan Animalia (hewan). Filum ini mencakup semua cacing pipih kecuali Nemertea, yang dulu merupakan salah satu kelas pada Platyhelminthes, yang telah dipisahkan.[1] Ciri-ciri Tubuh pipih dosoventral dan tidak bersegmen. Umumnya, golongan cacing pipih hidup di sungai, danau, laut, atau …

1939 film by Thorold Dickinson This article is about the film. For the novel, see The Arsenal Stadium Mystery (novel). The Arsenal Stadium MysteryArsenal manager George Allison gives a tactical team-talk to his playersDirected byThorold DickinsonWritten byThorold DickinsonDonald BullPatrick KirwanAlan HymanBased onThe Arsenal Stadium Mystery by Leonard Gribble.[1][2]Produced byJosef SomloStarringLeslie BanksGreta GyntIan McLeanLiane LindenAnthony BushellEsmond KnightCinematograph…

Planaria Dugesia subtentaculata, seekor dugesiidae. Klasifikasi ilmiah Kerajaan: Animalia Filum: Platyhelminthes Kelas: Rhabditophora Ordo: TricladidaLang, 1884 Subordo Maricola Cavernicola Continenticola Planaria termasuk dalam Filum Platyhelminthes yang memiliki bentuk tubuh pipih dan simetri bilateral. Planaria berhabitat di daerah bertemperatur 18–24 °C dengan ketinggian antara 500–1500 m dpl. Tubuh planaria tersusun dari bagian cranial, trunchus dan caudal. Bagian cranial terdapat…

Nizar Qabbaniنزار قبانيBerkas:Nizarqabbani.jpgLahir(1923-03-21)21 Maret 1923Damaskus, SuriahMeninggal30 April 1998(1998-04-30) (umur 75)London, InggrisPekerjaanDiplomat, penyair, penulis, penerbitKebangsaanSyrianWebsitenizarq.com Nizar Tawfiq Qabbani (Arab: نزار توفيق قبانيcode: ar is deprecated , Nizār Tawfīq Qabbānī) (21 Maret 1923 – 30 April 1998) adalah seorang diplomat, penyair dan penerbit Suriah.[1] Biografi Kehidupan awal Qabbani pada masa muda. …

Saleh Husin Ketua Majelis Wali Amanat Universitas Indonesia ke-4Masa jabatan26 Maret 2019 – 10 Februari 2023 PendahuluErry Riyana HardjapamekasPenggantiNoni Purnomo[1]Menteri Perindustrian Indonesia Ke-24Masa jabatan27 Oktober 2014 – 27 Juli 2016PresidenJoko Widodo PendahuluMohamad Suleman HidayatPenggantiAirlangga Hartarto Informasi pribadiLahir16 September 1963 (umur 60)Rote, IndonesiaPartai politikHanuraAnak3Alma materUniversitas KrisnadwipayanaProfe…

Ken RadhiqLahirRadhiq Ken Nuansa26 Desember 1995 (umur 28)Blitar, Jawa Timur, IndonesiaNama lainKen Radhiq, RaituwekPekerjaanPelawak tunggal, perawatTahun aktif2016—sekarang Radhiq Ken Nuansa (lahir 26 Desember 1995) adalah seorang pelawak tunggal berkebangsaan Indonesia. Ken, sapaannya sehari-hari bekerja sebagai seorang perawat di salah satu rumah sakit di Malang sejak 2016. Selain sebagai seorang perawat, Ken juga merupakan seorang pelawak tunggal atau komika yang telah aktif…

Halaman ini berisi artikel tentang negara historis. Untuk negara modern setelah 1949, lihat Republik Tiongkok. Pemerintahan Nasional Direorganisasi Republik Tiongkok beralih ke halaman ini. Untuk Pemerintahan oleh Chiang Kai-Shek di Chongqing, lihat Republik Tiongkok (1912-1949). Untuk pemerintahan pertama di tiongkok yang di proklamasikan setelah jatuhnya Dinasti Qing, lihat Pemerintahan Beiyang. Pemerintahan Nasional Direorganisasi Republik Tiongkok中華民國改組後國民政府 Zhōnghuá …

Artikel ini sebatang kara, artinya tidak ada artikel lain yang memiliki pranala balik ke halaman ini.Bantulah menambah pranala ke artikel ini dari artikel yang berhubungan atau coba peralatan pencari pranala.Tag ini diberikan pada Februari 2023. Artikel ini bukan mengenai Gletser Gray. Gletser GreyJenisGletser pegununganLokasiChiliKoordinat50°57′S 73°15′W / 50.950°S 73.250°W / -50.950; -73.250Luas270 km2 (100 sq mi) [1]Panjang28 km (17&…

Sakon Nakhon สกลนครProvinsi LambangPeta Thailand dengan Provinsi Sakon Nakhon yang diarsirNegara ThailandIbu kotaSakon NakhonPemerintahan • GubernurSombat Triwatsuwan (sejak Maret 2009)Luas • Total9.605,8 km2 (37,088 sq mi)Peringkat19Populasi (2000) • Total1.040.766 • Peringkat17 • Kepadatan11/km2 (28/sq mi) • Peringkat kepadatan43Zona waktuUTC+7 (Zona waktu Thailand)Kode I…

County in Kangwŏn Province, North KoreaCh'ŏnnae County 천내군CountyKorean transcription(s) • Chosŏn'gŭl천내군 • Hancha川內郡 • McCune-ReischauerCh'ŏnnae-gun • Revised RomanizationCheonnae-gunMap of Kangwon showing the location of ChonnaeCountryNorth KoreaProvinceKangwŏn ProvinceAdministrative divisions1 ŭp, 3 workers' districts, 15 riArea • Total385.6 km2 (148.9 sq mi)Population (2008[1])…

1967 film Trap for Seven SpiesDirected byMario AmendolaWritten byMario Amendola Antonio RomanStarringYvonne Bastien Eduardo FajardoCinematographyJosé F. AguayoEdited byLuciano CavalieriMusic byLallo GoriRelease date1 Dec 1966[1] Trap for Seven Spies (Italian: Trappola per sette spie, Spanish: Siete espías en la trampa) is a 1966 Italian-Spanish international co-production spy film written and directed by Mario Amendola and starring Yvonne Bastien, Eduardo Fajardo and Carlo Giuffré. …

Marasuchus Periode Trias Akhir, 235–234 jtyl PreЄ Є O S D C P T J K Pg N ↓ Restorasi kerangkaTaksonomiKerajaanAnimaliaFilumChordataKelasReptiliaGenusMarasuchus Sereno, 1974 Tata namaSinonim takson Lagosuchus lilloensis Romer 1972 Lagosuchus talampayensis? Romer 1971 Ex taxon authorAlfred Romer lbs Marasuchus (artinya buaya Mara) adalah sebuah genus arkosaurus dinosauriform basal yang mungkin merupakan sinonim dari Lagosuchus.[1] Kedua genera tersebut hidup pada zaman Trias…

イスラームにおける結婚(イスラームにおけるけっこん)とは、二者の間で行われる法的な契約である。新郎新婦は自身の自由な意思で結婚に同意する。口頭または紙面での規則に従った拘束的な契約は、イスラームの結婚で不可欠だと考えられており、新郎と新婦の権利と責任の概要を示している[1]。イスラームにおける離婚は様々な形をとることができ、個人的…

City in Semigallia, Latvia Mitava redirects here. For the steamship, see SS Mitava. State city in LatviaJelgavaState cityAerial view of Jelgava FlagCoat of armsBrandmarkJelgavaLocation in LatviaCoordinates: 56°38′54″N 23°42′50″E / 56.64833°N 23.71389°E / 56.64833; 23.71389Country LatviaTown rights1573Government • MayorAndris Rāviņš[1] (LZS) • Number of City Council members15Area[2] • Total60.56 k…

Kembali kehalaman sebelumnya