Pepeganga Margarita nace en 1985, con el apoyo de la tienda de bajo costo Pepeganga. Uno de los hechos más notorios desde el momento de su fundación era que el equipo jugaba de local en el campo de béisbol de Guatamare, que se había adaptado para el uso futbolístico. El club logra hacerse con el título de la segunda división venezolana en 1987, por lo cual accede a la primera división para la temporada 1987/1988. Su segunda temporada en la máxima categoría fue sorpresiva y logró el subcampeonato, siendo superado por un punto por Mineros de Guayana. La temporada 1989/1990 fue la última actuación de Pepeganga Margarita, que debió retirarse al final del campeonato por problemas financieros, otorgando sus derechos a Monagas Sport Club, desde la temporada 1990/1991.
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