El distrito de Frisia Septentrional se ubica al noroeste del estado federal y limita al norte con Dinamarca, al este tiene frontera administrativa con el distrito de Schleswig-Flensburg (el Fluss forma parte de una de las fronteras naturales) y al sur limita con el distrito de Dithmarschen (el Eider hace de frontera natural). Al oeste tiene costa con el mar del Norte. Uno de los acantilados más septentrionales es la isla Sylt, la denominada Ellenbogen, es de los territorios más al norte de Alemania. Los puntos de mayor altitud son el Sandesberg en el municipio de Ostenfeld (Husum) con una altitud de 54 m sobre NN y el Uwe-Düne en Kampen con 52,5 metros sobre el Normalnull.