Poco antes de cumplir 74 años, su esposo murió a los 73 años el 19 de abril de 1882. Posteriormente, Emma pasó los veranos en Down House. Compró una casa grande llamada The Grove en Huntingdon Road en Cambridge y vivió allí durante los inviernos. Emma murió en 1896. Su hijo Francis tenía una casa, a la que llamó Wychfield, construida en los terrenos de The Grove. Vivió allí durante la mayoría de los inviernos, pasando los veranos en Gloucestershire . Horace, el hijo de Emma, también hizo construir una casa en los terrenos y la llamó The Orchard.
Está enterrada en la Iglesia de Santa María en Downe, junto a otros miembros de su familia, a excepción de su esposo, que reposa en la Abadía de Westminster.