Fue candidato a presidente de la República del Brasil en las elecciones presidenciales de 1989, de 1994 y de 1998. Obtuvo más de 4 millones de votos en las elecciones de 1994, pero quedó en tercer lugar, perdiendo contra Fernando Henrique Cardoso y Lula. En 2002, fue elegido como diputado federal y reelegido en 2006 como el más votado de Brasil por el estado de São Paulo.[4] Se destacó por su activismo contra el comunismo y lo que consideraba abusos de la economía neoliberal. También estaba contra el aborto y contra el matrimonio homosexual.
Muerte
Enéas se sometió a quimioterapia en un hospital por leucemia mieloide. Cuando quedó claro que su tratamiento no estaba resultando en mejoras, decidió regresar a casa, donde permaneció hasta su muerte el 6 de mayo de 2007, aproximadamente a las 14 horas, en el barrio de Laranjeiras, en el sur de Río de Janeiro. Sus restos fueron incinerados y sus cenizas esparcidas sobre la Bahía de Guanabara.[5]