Era hijo de Teodosio II, séptimo duque de Braganza y la duquesa Ana de Velasco y Girón, noble de la corte española e hija del duque Juan Fernández de Velasco, con la duquesa María de Téllez-Girón. Juan heredó la titularidad de la casa ducal en 1630 como Juan II y fue el octavo duque de Braganza, el quinto duque de Guimarães y el tercer duque de Barcelo. También fue el séptimo marqués de Vila Viçosa y el conde de Barcelos, Guimarães, Arraiolos, Ourém y Neiva, y también el decimocuarto agente de Portugal.
Títulos y estilos
19 de marzo de 1604 - 29 de noviembre de 1630: "Su señoría, Don Juan de Braganza"
29 de noviembre de 1630 - 1 de diciembre de 1640: "Su Excelencia, el duque sereno de Braganza, etc."
1 de diciembre de 1640 - 6 de noviembre de 1656: "Su Majestad el Rey"
El estilo oficial del Rey Juan IV como Rey de Portugal: "Por la Gracia de Dios, Juan IV, Rey de Portugal y los Algarves, d'Aquém y d'Além-Mar en África, Señor de Guinea y la Conquista, Navegación y Comercio desde Etiopía, Arabia, Persia e India, etc."
Dei gratia rex Portugaliæ & Algarbiorum citra ultraque mare in Africa, dominus Guineæ, atque expugnationis, navigationis, & commercii Æthiopiæ, Arabiæ, Persiæ, & Indiæ, &c
En portugués: Pela Graça de Deus, Rei de Portugal e dos Algarves, d'Aquém e d'Além-Mar em África, Senhor da Guiné e da Conquista, Navegação e Comércio da Etiópia, Arábia, Pérsia e Índia, etc.
En español, el título regio se traduciría como:
Por la Gracia de Dios, Rey de Portugal y de los Algarves, ambos lados del mar en África, Señor de Guinea y de la Conquista, Navegación y Comercio de Etiopía, Arabia, Persia y la India, etc.