En Londres, alrededor de 1900, los preparativos de George (Jorge en español) y Mary Darling para asistir a una fiesta se ven interrumpidos por los juegos de sus hijos, John y Michael (Juan y Miguel en español), que representan una historia de Peter Pan y los piratas que les contó su hermana mayor, Wendy. George, que está harto de las historias que han hecho a sus hijos menos prácticos, declara enojado que Wendy se ha hecho demasiado mayor para seguir en la guardería con los niños. Esa noche, el propio Peter Pan los visita en la guardería, quien les enseña a volar con la ayuda de su mejor amiga hada, Campanilla, y los lleva con él a la isla de Nunca Jamás.
Un barco de piratas esta anclado en Nunca Jamás, comandado por el Capitán Garfio con su compañero, el Sr. Smee. Hook intriga audazmente para vengarse de Peter Pan por cortarle la mano, pero tiembla ante la presencia de un cocodrilo que había consumido la mano y está ansioso por probar el resto de él. La inquietud de la tripulación se ve interrumpida por la llegada de Peter y los Darling. Campanilla, quien está muy celosa de la atención que Peter le da a Wendy, convence a los Niños Perdidos de que Peter les ordenó que derriben a Wendy, a lo que Campanilla se refiere como un "pájaro Wendy". Los Niños Perdidos ven a Wendy acercarse y la derriban, Wendy iba a caer encima de unas rocas y Peter la rescata cargandola. La traición de Campanilla pronto se descubre, y Peter la destierra. John y Michael partieron con los Niños Perdidos para encontrar a los indios de la isla, quienes en su lugar los capturan, creyendo que eran los responsables de llevarse a la hija del jefe, Tiger Lily.
Mientras tanto, Peter lleva a Wendy a ver a las traviesas sirenas, que se deleitan en atormentar a Wendy pero huyen aterrorizadas al ver a Garfio. Peter y Wendy ven que Garfio y Smee han capturado a Tiger Lily para convencerla de que revele el escondite de Peter. Peter y Wendy la liberan, y Peter es honrado por la tribu. Luego, Garfio planea aprovecharse de los de Wendy de Campanilla, engañándola para que revele la ubicación de la guarida de Peter. Wendy y sus hermanos finalmente sienten nostalgia y planean regresar a casa. Invitan a Peter y a los Niños Perdidos a regresar a Londres y ser adoptados por los padres Darling. Los Niños Perdidos están de acuerdo, pero Peter está tan en contra de crecer que se niega, presumiblemente pensando que todos regresarían en breve. Los piratas acechan y capturan a los Niños Perdidos y a los Darling cuando salen, dejando atrás una bomba de tiempo para matar a Peter. Campanilla se entera de la trama justo a tiempo para arrebatarle la bomba a Peter mientras explota.
Peter rescata a Campanilla de los escombros y juntos se enfrentan a los piratas, liberando a los niños antes de que puedan caminar por la tabla. Peter se enfrenta a Garfio en un combate individual mientras los niños pelean contra la tripulación, y logran humillar al capitán. Garfio y la tripulación huyen, con el cocodrilo en la persecución. Peter comanda galantemente el barco desierto y, asistido por el polvo de hada de Campanilla, lo lleva a Londres con los niños a bordo. Sin embargo, los Niños Perdidos deciden regresar a Nunca Jamás en lugar de ser adoptados en Londres. George y Mary Darling regresa a casa de la fiesta y encuentran a Wendy no en su cama, sino durmiendo en la ventana abierta. Wendy despierta y cuenta con entusiasmo sus aventuras. Los padres miran por la ventana y ven lo que parece ser un barco pirata en las nubes. George, que ha suavizado su posición sobre que Wendy se quede en la guardería, y revela que el mismo tuvo una aventura en Nunca Jamás cuando era un niño, y ahora reconoce el barco que no había visto desde su propia infancia.
Bobby Driscoll, Kathryn Beaumont, Paul Collins, Tommy Luske and The Jud Conlon Chorus (Inglés) Nicky Tavares, Teresita Escobar, Miguel Ángel Erros, Arturo David y Ortigosa y Coros (Español)
La melodía de la canción The Second Star to the Right (La segunda estrella a la derecha) fue escrita originalmente para Alicia en el país de las maravillas para una canción llamada Beyond the Laughing Sky (Más allá del cielo sonriente).
En la obra al Capitán Garfio le falta la mano derecha, pero los artistas de Walt Disney creían que eso limitaba demasiado la acción, así que decidieron que le faltase la izquierda.
Para dibujar al Capitán Garfio se tomó como modelo a Henry Brandon.