La Supercopa de España de 1999 fue la XVI edición del torneo, correspondiente a la temporada 1999-00. Se disputó doble partido en España entre los días 8 y 15 de agosto. Enfrentó al campeón de la Primera División 1998-99, el F. C. Barcelona, y el campeón de la Copa del Rey 1998-99, el Valencia C. F. El Valencia Club de Fútbol se adjudicó el título por primera vez en su historia en su primera participación tras vencer en el computo global por 4:3.
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