À 56 ans, il connait un passage à vide de près de trois ans à la suite de son limogeage du Torino en février 2007. Il est nommé entraîneur de la Juventus Turin à la place de Ciro Ferrara, limogé en raison des mauvais résultats du club et dirige son premier entraînement le .
Il ne reste que quatre mois, avant de devenir sélectionneur du Japon. Pour son premier match, il bat l'Argentine à Saitama 1-0. Il remporte la Coupe d'Asie des nations de football 2011 avec le Japon en battant en finale l'Australie sur le score de 1 à 0 dans la prolongation. Il permet ainsi au Japon de remporter son quatrième titre dans cette compétition.