1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour : 16 décembre 2023
D'origine sénégalaise[1], Aly Cissokho est le quatrième d'une famille de cinq enfants (trois grands frères et une petite sœur). L'un de ses frères, Issa Cissokho, est d'ailleurs lui aussi professionnel.
Il commence le football à l'âge de six ans au AAJ Blois (Blois Football 41 à partir de 1999) puis au Football Club olympique de Saint-Jean-de-la-Ruelle avant de se faire remarquer par le FC Gueugnon.
FC Gueugnon
Formé à Gueugnon, il débute sous la houlette de Victor Zvunka et joue un match lors de la saison 2006-2007 de Ligue 2. La saison suivante, toujours en Ligue 2, il joue 21 rencontres, dont 14 comme titulaire.
Vitoria Setubal
Ses performances honorables ne parviennent cependant pas à sauver le club bourguignon d'une relégation en National (3e division). Cissokho quitte alors le club pour s'engager avec le Vitoria Setubal en première division portugaise. Auteur de belles performances, Cissokho fait ses débuts en Coupe UEFA contre le SC Heerenveen le .
FC Porto
Six mois seulement après son arrivée au Portugal, il est transféré au mercato hivernal vers le prestigieux club du FC Porto pour une somme de 300 000 euros (60 % des droits du joueur), et connaît alors la Ligue des champions puisqu'il est titularisé lors des rencontres victorieuses en huitièmes de finale face à l'Atlético Madrid.
Le , face à Manchester United pour les quarts de finale, il réalise un excellent match à Old Trafford en parvenant notamment à museler les attaques de Wayne Rooney et Cristiano Ronaldo. Dès lors, le jeune joueur est suivi par de nombreux clubs de renommée internationale.
Le , le Milan AC fait une offre de l'ordre de quinze millions d'euros[2] (offre acceptée par le FC Porto) mais annule par la suite le transfert à cause d'un problème de dentition révélé lors de la visite médicale[3], ce problème pouvant avoir un effet sur la posture du joueur et pouvant causer des pubalgies récurrentes. Le joueur nie le problème de santé et prétend qu'il s'agit d'une fausse excuse pour couvrir en réalité un différend financier qui existe entre les deux clubs[4].
Olympique lyonnais
Mi-juillet, le FC Porto et l'Olympique lyonnais se mettent d'accord pour son transfert (15 millions d'euros et 20 % sur la plus-value d'un éventuel transfert suivant[5]). Le joueur signe un contrat de cinq ans[6].
Il rejoint alors son ancien coéquipier du FC Porto, Lisandro López, transféré peu de temps avant lui du club portugais chez le septuple champion de France.
Le , il joue son premier match avec l'Olympique lyonnais en Coupe de la Paix face au Beşiktaş JK (match nul 1-1). Deux jours plus tard, il joue face à son ancien club, le FC Porto (défaite de l'OL 2-0, doublé de Hulk). L'Olympique lyonnais est éliminé de la Coupe de la Paix après cette défaite face aux Portugais.
Le , lors du match de Ligue des champions face au club hongrois de Debrecen VSC, Aly Cissokho inscrit son tout premier but sous les couleurs lyonnaises d'une frappe du pied gauche (victoire 4-0). Contre le Paris Saint-Germain, et après 41 matchs en Ligue 1, le , il marque son premier but en championnat.
Le , il participe à la victoire exceptionnelle de l'OL en Ligue des champions sur la pelouse du Dinamo Zagreb[7], délivrant notamment deux passes décisives. Grâce à un score de 1-7, les Lyonnais reprennent contre toute attente la seconde place de leur groupe à la différence de buts et accèdent aux huitièmes de finale pour la neuvième année consécutive.
Le , Aly Cissokho subit une opération dentaire visant à repositionner sa mâchoire. Selon certains médias, il s'agit d'une intervention ayant pour but de corriger le défaut détecté par le Milan AC lors de son transfert avorté en 2009 afin qu'une future vente du joueur ne puisse pas être annulée de nouveau à la suite de la visite médicale[8].
Dès le début de saison 2012-2013, Aly Cissokho est poussé vers la sortie par le président Jean-Michel Aulas qui met publiquement en doute l'implication du joueur sur le terrain[9].
Le , huit mois jour pour jour après son opération dentaire, l'OL annonce qu'un accord est trouvé avec le Valence CF pour le transfert du joueur sur la base d'un contrat de quatre ans[10].
FC Valence
Le lendemain, Cissokho est officiellement présenté à la presse[11].
Il joue son premier match face au FC Barcelone le (défaite 1-0).
Le , jour de son 25e anniversaire, il marque son premier but face au Celta Vigo (victoire 2-1).
Prêt à Liverpool
Le , Cissokho signe un contrat de prêt d'une saison en faveur du club anglais de Liverpool. Il joue son premier match le face à Aston Villa (victoire 1-0).
Aston Villa
Après son expérience en Premier League à Liverpool, Aly Cissokho s'engage pour quatre ans avec Aston Villa le .
Prêt au FC Porto
Le , il est prêté pour une saison au FC Porto. Après seulement trois apparitions sous le maillot du club portugais, Cissokho est rappelé par son entraîneur Rémi Garde mi-.
Prêt à l'Olympiakos
Le , il est prêté à l'Olympiakos jusqu'à la fin de la saison, ce prêt étant assorti d'une option d'achat. Le club grec ne lève pas cette option d'achat et Cissokho retourne à Aston Villa après avoir pris part à dix rencontres.
Turquie
Le , le défenseur français signe un contrat de deux ans avec le club turc du Yeni Malatyaspor, promu en Süper Lig[12]. Il dispute trente-deux matchs toutes compétitions confondues lors de son unique saison sous le maillot du club turc.
À l'été 2020, il décide de revenir dans sa ville natale de Blois et signe dans le club de l'AFC Blois 1995, qui évolue alors au troisième niveau de la région Centre-Val de Loire. Six mois plus tard, il prend la direction du Fursan Hispania FC, club de troisième division émiratie qu'entraîne l'ancien footballeur espagnol Míchel Salgado[14].
Il est de nouveau convoqué pour le match amical contre l'Espagne le .
À la suite de la grève des joueurs français lors de la Coupe du monde et de la suspension de nombreux joueurs, il est une nouvelle fois convoqué, cette fois-ci par le nouveau sélectionneur Laurent Blanc. Il dispute alors l'intégralité d'un match amical contre la Norvège le , ce qui constitue sa seule sélection en sélection nationale.