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Le club est fondé le . Il se revendique comme le plus titré du pays.
En 2017, en finale de coupe du Congo, l'AC Colombe domine (3-2) son rival historique, le FCF La Source, et retrouve sa couronne en coupe du Congo, après les sacres de 2001, 2005 et 2009[1]. L'équipe conserve son trophée l'année suivante en battant en finale l'AS Epah Ngamba (1-0)[2].
L'AS Colombe remporte le championnat en 2021, signant son 22e sacre[3]. Ce trophée qualifie le club pour le tournoi éliminatoire UNIFFAC de la Ligue des champions de la CAF. Malheureusement, un manque de financements empêche l'équipe de se déplacer à Malabo pour la compétition[4].