CLR, sigle composé des trois lettres C, L et R, peut faire référence à :
- Common Language Runtime, un composant de machine virtuelle du framework .NET de Microsoft ;
- Compagnie luxembourgeoise de radiodiffusion, une structure luxembourgeoise aujourd'hui intégrée au groupe RTL ;
- Liste de révocation de certificats ;
- Choisy-le-Roi, une commune française du Val-de-Marne ;
- Central London Railway, une ligne historique du métro de Londres ;
- CLR, le nom donné au livre Introduction à l'algorithmique, à cause de ses auteurs Cormen, Leiserson et Rivest ;
- Cercle des libéraux réformateurs, un parti politique gabonais ;
- Comité Laïcité République, une association française ;
- Compagnie légère de renseignements, dans l'Armée de terre ;
- C-type lectin receptor (en), une catégorie de récepteurs de reconnaissance de motifs moléculaires ayant les caractéristiques d'une lectine de type C.
CLR est aussi un code qui peut faire référence à :