Il réalise sa meilleure performance en D2 lors de la saison 1962/1963, où il se classe 8e du championnat (Groupe II), avec un total de 13 victoires, 3 matchs nuls et 14 défaites.
Le , le CD Eldense retrouve la deuxième division après 59 ans d'absence, en battant en finale des barrages le Real Madrid Castilla sur le score cumulé de 4-4[Note 1] (1-1 à l'aller, et 3-3 au retour)[1].
Scandale: un match truqué par des paris ?
Lors de la saison 2016-2017, le club d'Eldense, évoluant alors en D3 espagnole, se retrouve impliqué dans un scandale à la suite de soupçons de match truqué après la rencontre contre le FC Barcelona B (lourde défaite 0 - 12). On soupçonne des joueurs ainsi que l'entraîneur du club d'avoir pris part à des paris illégaux contre leur club[2],[3].
↑En cas d'égalité après la fin des prolongations, l'équipe la mieux classée est déclaré vainqueur (le CD Eldense avait terminé 2e, et le Real Madrid Castilla 3e)
