Fondé en 1998, le club dispute ses deux premières saisons dans le championnat régional de l'oblast de Moscou. Il intègre la quatrième division à partir de 2007 et y évolue jusqu'en 2012, remportant le groupe Podmoskovié à l'issue de cette dernière année. Découvrant par la suite le monde professionnel et la troisième division lors de la saison 2012-2013, il devient un acteur régulier du haut de classement du groupe Ouest. Il termine notamment deuxième de ce groupe par trois fois en 2016, 2017 et 2020.
À la fin du mois de , le club fusionne avec l'Olimp Khimki pour former l'Olimp-Dolgoproudny sur la base de l'ancien FK Dolgoproudny, avec l'objectif affiché d'intégrer la deuxième division[1]. La direction de l'équipe est alors récupérée par Rinat Bilialetdinov, entraîneur de l'Olimp[2]. Malgré un changement d'entraîneur en cours de saison avec l'arrivée d'Aleksandr Totchiline au mois de , l'Olimp domine largement son groupe au cours de la saison 2020-2021 et, avec quatre matchs restants, s'assure la première position ainsi que la montée au deuxième échelon pour la première fois de son histoire[3].
Au début du mois de , la fusion initiée l'année précédente est dissoute tandis que le deux clubs fondateurs forment à nouveau deux entités distinctes, l'une participant à la deuxième division avec un effectif nouveau tandis que l'autre reste au troisième échelon et se constitue de joueurs venant de Khimki et des académies du Tchertanovo Moscou et du Master-Saturn de Iegorievsk. L'équipe jouant la deuxième division conserve malgré tout l'appellation « Olimp-Dolgoproudny », car ayant obtenu sa licence sous ce nom[4]. L'entraîneur Totchiline quitte dans la foulée ses fonctions au club[5]. Pour ses débuts au deuxième échelon, le club se trouve perpétuellement mêlé à la course au maintien, parvenant malgré tout à conserver une certaine marge avec la relégation tout au long de l'exercice 2021-2022. L'Olimp connaît malgré tout deux changements d'entraîneur au cours de la saison, avec le départ de Roman Pylypchuk(en) au cours de la trêve hivernale[6] remplacé par le bref retour en poste de Totchiline qui s'en va lui aussi à la fin du mois d'avril 2022[7]. C'est finalement Denis Ievsikov qui prend les rênes pour les dernières journées et parvient à confirmer le maintien sportif de l'équipe.
Peu après la fin de saison, l'Olimp se voit cependant refuser la licence pour prendre part à la deuxième division et est rétrogradé administrativement[8]. Il ne prend pas non plus part au troisième échelon.
Bilan sportif
Classements en championnat
La frise ci-dessous résume les classements successifs du club en championnat de Russie depuis 2001.