Fernando Filoni est né le à Manduria, dans la province de Tarente située dans la région des Pouilles en Italie, est entré au séminaire et a fait un doctorat en philosophie et en droit Canon en 1978 quand le cardinal Tarcisio Bertone y était professeur. Il est ordonné prêtre pour le diocèse de Nardò le .
Le , le cardinal Filoni est envoyé par le pape François comme envoyé spécial auprès des populations chrétiennes d'Irak persécutées pour leur apporter réconfort et solidarité[9]. Le 14 août suivant à Erbil, il fait état d'un grand besoin de solidarité de la part de ces populations, et fait aussi état de la situation militaire incertaine qui règne, et estime donc un besoin militaire. Il rencontre aussi le président du gouvernement kurdeMassoud Barzani[10]. Initialement prévu comme participant du voyage du Saint-Père en Corée du Sud, il est placé au centre des prières au cours de la messe de clôture du voyage le 18 mai[11]. Il finit sa visite par une rencontre avec le président irakien Fouad Massoum, accompagné du nonce apostolique en Irak Giorgio Lingua et du patriarche chaldéen Louis Raphaël Ier Sako dans le but de lui remettre une lettre spéciale du pape et le rassurer sur le motif de sa visite qui est « humanitaire et non politique »[12]. Lors de son retour il est immédiatement reçu par François, montrant ainsi l'importance que celui-ci donne à la mission du cardinal en Irak. Au cours de celle-ci il explique qu'il a commencé à distribuer une somme d'un million de dollars[13] en faveur des catholiques et de la communauté yézidie[14].
Face à l'augmentation de la violence en Irak, le pape décide d'y renvoyer une nouvelle fois le cardinal Filoni, cette fois-ci pendant la semaine sainte, afin de montrer son attachement aux familles persécutées, pour lesquelles le cardinal se présente cette fois-ci avec une collecte faite dans le diocèse de Rome[15].
Relations avec le Vietnam
Le , il effectue une visite pastorale en tant qu'envoyé spécial du Saint-Siège dans sa mission de préfet de la congrégation pour l'évangélisation des peuples. Cette visite intervient dans le cadre de l'amélioration du dialogue entre le Saint-Siège et le Vietnam, qui n'ont pu encore établir des relations diplomatiques. Le Saint-Siège a pu obtenir la présence d'un représentant non permanent à Hanoï, et que celui-ci puisse effectuer quelques visites pastorales. La visite pastorale du cardinal Filoni consiste à rencontrer la conférence épiscopale du Vietnam, et d'une visite du sanctuaire marial de La Vang pour rencontrer le clergé. Cette visite se tournera ensuite sur le 400e anniversaire de l’évangélisation du Vietnam et les cinquante ans du diocèse de Xuan Loc[16].
Ouvrage
Et toute la maison fut remplie de l'odeur du parfum : Pour une spiritualité de l'ordre du Saint-Sépulcre, Salvator, 2021.
Qui sont les 22 nouveaux cardinaux ? Liste et biographies des 22 nouveaux cardinaux créés lors du consistoire du 18 février 2012 par Benoît XVI, in La Croix, 6 janvier 2012, [article en ligne]
