Cette sorte de base, de formule bruteC5H4N4O, est présente en très petites quantités dans les acides nucléiques. Ainsi, on peut en retrouver dans les anticodons d'ARNt, ce qui joue un rôle dans l'appariement aspécifique avec la troisième base du codon (phénomène appelé "wobble" par les anglosaxons, lié à la dégénérescence du code génétique).
Récemment, le FBI et Scotland Yard ont annoncé être en train de mettre au point une technique permettant de mesurer le taux d'hypoxanthine dans le globe oculaire d'un mort jusqu'à 4 jours après son décès, afin de déterminer l'heure exacte de celui-ci[2].
