Brisbane City (2014-2016) et Queensland Reds (2015-2017)
En 2014, il rejoint Brisbane City avec qui il remporte la saison inaugurale du National Rugby Championship (NRC). Par la suite, il signe un contrat dans l'élite du rugby australien, le Super Rugby avec les Queensland Reds en 2015. Il fait ses débuts dans le Super Rugby le 15 mai 2015 face aux Melbourne Rebels et il inscrit un essai lors de ce match[2]. Il commence sa saison aussi tard en raison d'une blessure au genou qui l'a privé du début de la saison[3].
Entre 2014 et 2017, il dispute 23 matchs de Super Rugby et 26 matchs de NRC[4].
SU Agen (2017-2019)
En juillet 2017, il rejoint le Top 14 en s'engageant pour deux saisons avec le SU Agen[5]. Il dispute son premier match le 26 août 2017 lors de la 1re journée de championnat en tant que titulaire face au Montpellier Hérault rugby[6]. Il inscrit son premier essai en Top 14 lors de la 5e journée de championnat face à la Section paloise[7]. Il termine la saison 2017-2018 de Top 14 avec 21 matchs disputés, 2 essais et 181 points marqués et termine sixième meilleur réalisateur de la saison. Lors de la saison 2018-2019 de Top 14, il dispute 24 matchs, inscrit 3 essais et 143 points marqués et termine dixième meilleur réalisateur de la saison.
ASM Clermont (2019-2020)
En janvier 2019, en fin de contrat avec Agen en juin 2019, il s'engage pour deux saisons avec l'ASM Clermont Auvergne[8]. Il fait ses débuts lors de la 1re journée de la saison 2019-2020 de Top 14 en tant que titulaire face au Stade rochelais[9]. Jusqu'en février 2020, il dispute 16 matchs de Top 14 et inscrit 109 points, faisant de lui le septième meilleur réalisateur de la saison, avant l'arrêt définitif de la saison en raison de la pandémie de Covid-19[10].
Durant cette saison, il dispute également 4 matchs de Champions Cup et inscrit un essai le 15 décembre 2019 face à Bath Rugby en match de poule[11].
Western Force (2021-2022)
Souhaitant pouvoir être sélectionnable avec l'équipe d'Australie, Jake McIntyre quitte ASM Clermont un an avant la fin de son contrat et retourne dans son pays natal en s'engageant avec la Western Force en novembre 2020[12]. Il fait ses débuts le 19 février 2021 lors de la 1re journée du Super Rugby AU face aux Brumbies (défaite 11 à 27)[13]. Il dispute 5 matchs dans cette première partie de la saison 2021 du Super Rugby. Par la suite, il dispute 3 matchs du Super Rugby Trans-Tasman.
Lors de la saison 2022 du Super Rugby, il dispute 13 matchs de championnat et inscrit 3 essais, le premier le 20 février 2022 face aux Brumbies[14], puis deux essais le 24 mai 2022 face au Moana Pasifika[15].
USA Perpignan (depuis 2022)
Jake McIntyre, il revient en Top 14 en s'engageant en mars 2022 pour trois saisons avec l'USA Perpignan[16]. Il commence la saison 2022-2023 de Top 14 lors de la 1re journée face à la Section paloise[17]. Durant cette saison, il dispute 19 matchs de Top 14 et inscrit 4 essais. Il joue aussi un match de Challenge Cup face aux Glasgow Warriors contre qui il inscrit un essai[18].
Lors de la saison 2023-2024, il est le premier capitaine de la saison lors de la 1re journée de Top 14 face au Stade français Paris[19]. Le 25 octobre 2023, il prolonge son contrat pour deux saisons supplémentaires[20].
