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Jean-Luc Gaget débute très jeune comme assistant-réalisateur. Parallèlement, il réalise ses premiers courts-métrages et fonde en 1983 la société de production Cinq et Cinq films avec notamment Laurent Bénégui et Luc Pagès. Il devient par la suite chef monteur, tout en continuant à réaliser ses propres courts-métrages, dont certains seront primés, et à écrire des scénarios pour d'autres réalisateurs.
Il est le chef monteur de plusieurs courts et longs-métrages, mais aussi producteur exécutif (Mille bornes d'Alain Beigel) et occasionnellement acteur. Il aborde en 2000 la réalisation de son premier long-métrage J'ai tué Clémence Acéra, qui sort en sur les écrans.