Après avoir été en désaccord avec de multiples décisions du gouvernement au début 2006, il se sépara du Parti du Yukon le pour sièger comme député indépendant. Il essaiera ensuite de réobtenir son siège pendant l'élection territoriale du 10 octobre 2006 en tant que candidat du Nouveau Parti démocratique du Yukon. Il fut réélu, et fit partie du caucus du NPD sous Todd Hardy jusqu'en , où il se sépara du NPD pour de nouveau sièger indépendamment[1]. Il redevient membre du Parti du Yukon le [2], et devient ministre de l'environnement[3]. Il annonce qui ne se représentera pas à l'élection yukonnaise du 11 octobre 2011.
Un mois après l'élection territoriale, le , Edzerza meurt d'une leucémie[4].