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La vieille ville de Lindau se trouve sur l'île du même nom sur le bord septentrional de l’Obersee. L'île, avec ses 68 hectares, ne représente qu’une infime partie du territoire de la commune actuelle.
Le 8 août 1796, eut lieu le combat de Lindau entre la division Laborde de l'armée de Rhin-et-Moselle et le corps autrichien du général Wolf qui voit la victoire des troupes française.
XIXe siècle
En 1802, avec la disparition du Saint-Empire romain germanique, Lindau perd ses privilèges impériaux. Le couvent millénaire des sœurs est sécularisé. En 1804, le prince Charles Auguste de Bretzenheim donne la ville et le couvent à l'Autriche. En 1806, l'Autriche rend la ville, qui est intégrée au Royaume de Bavière.
Le raccordement de Lindau au réseau de liaisons maritimes sur le lac de Constance a lieu en 1824. En 1856, la ville se dote d'un nouveau port et d'un phare, le seul de Bavière.
En 1853, la ville est raccordée au réseau ferroviaire avec la construction d'un pont. Lindau devient le terminus de la ligne Ludwig-Süd-Nord-Bahn(de) qui la relie à Hof, dans le Nord de la Bavière, viaAugsbourg et Nuremberg. Une liaison ferroviaire vers Brégence est réalisée en 1872.
XXe siècle
En 1922, la commune de Lindau, qui ne comprend alors que l'île, est fusionnée avec les localités situées sur la côte (Aeschach, Hoyren et Reutin).
En 1924, Ludwig Siebert devient le premier Oberbürgermeister (maire) du NSDAP de Bavière. Siebert devient ensuite ministre-président de Bavière après l'accession d'Adolf Hitler au pouvoir.
La ville de Lindau est dotée d'un parlement de 30 conseillers élus au système proportionnel pour une durée de six ans. Il ne siège plus sur l’île de Lindau, mais dans le quartier de Reutin.
Après les élections communales de , la répartition des sièges est la suivante :
Lindau est jumelée avec Chelles (France) depuis 1964.
Tourisme
La rue Maximilien, l’une des rues piétonnes de Lindau.
L’essentiel de l’activité touristique de la commune de Lindau se concentre sur Île de Lindau. L'entrée du port est gardée par une monumentale statue en grès de 6 mètres représentant un lion assis, symbole de la Bavière, érigée en 1856 par le sculpteur Johann von Halbig et par un ancien phare de 37 mètres de haut construit au XIIIe siècle.
Durant l'été, il y a beaucoup de touristes. L'atmosphère spéciale de la ville entourée d'eau et même le casino du Land de Bavière attirent beaucoup de monde. Les événements annuels sont les rencontres des lauréats du prix Nobel, des médecins de psychothérapie (Lindauer Psychotherapiewochen) et les Journées des architectes paysagistes (Gartentage Lindau).
Il y a deux routes de vacances qui mènent à ou sortent de Lindau. La Route verte (Europe), en allemand : Grüne Straße, qui commence dans les Vosges à Contrexéville et traverse comme route transfrontalière le Rhin entre Neuf-Brisach et Vieux-Brisach passe dans son itinéraire nord par Meersburg et se termine à Lindau. La Route des Alpes allemandes, en allemand : Deutsche Alpenstraße, commence à Lindau, passe par Garmisch-Partenkirchen, Berchtesgaden et mène vers la petite ville de Marktschellenberg près de Salzbourg.
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