1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour : 13 juin 2018
Sélectionné pour participer à l'Euro des moins de 18 ans en 2000, il est le meneur de jeu de l'équipe. Seul buteur lors du second match déjà décisif contre l'équipe de République tchèque, il double la mise lors du match suivant face à la Russie sur une passe en profondeur[2].
Il marque son premier but à l'occasion du match Troyes-Auxerre le (1-2). Dès lors, il ne fait que progresser, améliorant ses performances et son temps de jeu : 6 matchs en 2001, 25 l'année qui suit, 31 en 2003 et 25 en 2004 font de lui une valeur sûre de l'équipe auxerroise qui connaît alors sa « génération dorée » avec entre autres Djibril Cissé, Philippe Mexès et Jean-Alain Boumsong. Il est élu meilleur espoir en 2003[1]. Lors de la saison 2006-2007, il devient un cadre essentiel de son équipe, grâce à Jean Fernandez qui compte énormément sur lui, mais surtout car il a trouvé son vrai poste sur le terrain, c’est-à-dire milieu offensif centre.
Après un retour dans le Doubs pour la préparation de la prochaine saison, il constate qu'il n'entre pas dans les plans de l'entraineur et signe avec l'EA Guingamp pour 3 ans. Le , au terme d'une saison en National, Lionel retrouve la L2 après une victoire face à Rouen 3-1 aux dépens de Strasbourg qui finira 4e de cette division alors que Guingamp finira 3e. Le , il retrouve la L1, 5 ans après l'avoir quittée, grâce à une victoire, au Stade Jean-Laville de Gueugnon sur terrain neutre, face au Gazélec Ajaccio 1-0 lors de la 37e journée de championnat. Guingamp finira alors 2e au classement final derrière Monaco et devant Nantes.
Le , il remporte la Coupe de France pour la 4e fois de sa carrière, la 2e avec l'En Avant de Guingamp. Le , il dispute son dernier match sous le maillot de Guingamp contre Nice pour une défaite 2-3 au Stade du Roudourou, à l'âge de 34 ans.
Retour à Auxerre (2016-2017)
Le , il signe son retour à l'AJ Auxerre afin d'y apporter son expérience[3].
Le , à la suite du match AJ Auxerre-Red Star, comptant pour la 38e et dernière journée de Ligue 2. Lionel Mathis annonce sa retraite de joueur professionnel et son intégration dans le staff du centre de formation auxerrois[4].
Carrière d'entraineur
AJ Auxerre (2017-2018)
Le , il est nommé adjoint de David Carré qui sera responsable d'un groupe « post-formation » et du management de l'équipe réserve de l'AJ Auxerre[5].
Le , il est nommé adjoint de David Carré aux commandes de l'équipe première de l'AJ Auxerre par intérim à la suite du départ de Francis Gillot[6].
Le , à la suite de la nomination de Pablo Correa comme entraîneur de l'équipe première de l'AJ Auxerre, il reprend son poste d’entraîneur adjoint de l'équipe réserve de l'AJ Auxerre[7].
Stade Auxerrois (depuis 2018)
Le , il annonce rejoindre le Stade auxerrois, club évoluant en Régional 2, en tant qu’entraîneur principal à partir de la saison 2018-2019[8]. Pour sa première saison à la tête de l'équipe première, il obtient la promotion en Régional 1. Après plusieurs années en Régional 1, le club est relégué en Régional 2 à la fin de la saison 2023-2024[9].
Statistiques
Statistiques de Lionel Mathis au 28 septembre 2017[10],[11]