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Jusqu'en 2006, la programmation était culturelle avec un accent mis sur les régions des Pays-Bas. Par la suite, il y eut une réforme en 2006 sur l'audiovisuel. Suite cette réforme, les programmes sont centrés vers les jeunes et jeunes adultes et légèrement sur le divertissement. La chaîne diffuse également au moins treize heures de programmes pour enfants (sous les noms NPO Z@ppelin le matin et NPO Z@PP l'après-midi).
Le , Nederland 3 est renommée « NPO 3 » comme l'ensemble des chaînes du groupe Nederlandse Publieke Omroep. La chaîne poursuit son orientation de divertissement avec le talk-show à succès d'Arjen LubachZondag met Lubach, diffusé hebdomadairement depuis 2015.
