À l'inverse de gouverneurs généraux d'autres royaumes du Commonwealth, Sir Nathaniel Waena s'implique activement dans la vie politique de son pays. Ainsi, en , pour mettre fin à une crise politique, il convoque le Parlement, malgré les protestations du Premier ministre Manasseh Sogavare, qui souhaite que la session parlementaire soit retardée[1],[2],[3]. Le , il appelle le gouvernement à faire davantage d'efforts pour procurer des services essentiels aux régions rurales[4]. Le , il s'adresse aux députés, et affirme que l'économie du pays doit cesser de s'appuyer si lourdement sur l'exploitation du bois[5]. Le , il déclare qu'il « tiendrait responsables » les ministres du gouvernement si l'aide nécessaire n'était pas acheminée aux victimes du tsunami de 2007[6].
Cette manière d'exercer les fonctions de gouverneur général contraste par exemple avec l'Australie ou la Nouvelle-Zélande, où le gouverneur général est traditionnellement plus effacé.