Formé dans le club de Suez, Rifaat El-Fanageely est recruté par Al Ahly SC en 1953, le principal club égyptien de l'époque, dont il devient une pièce maitresse en défense[2] jusqu'en 1967[3] et avec lequel il remporte sept titres de champions et six coupes d'Égypte[4].
Avec la sélection nationale, il remporte également les deux premières éditions de la coupe d'Afrique des nations, en 1957 et 1959. Il est également de l'aventure en 1963, terminée à la troisième place de la compétition. Il prend sa retraite internationale en 1970[4].