Scott Pruett débute très tôt en karting mais n'obtiendra ses premières victoires importantes que dans les années 1980 en championnats IMSA GT et Trans-Am avec l'écurie Roush Racing.
Entre 1988 et 1999, il participe au CART où il remporte deux victoires en près de cent cinquante apparitions. Durant cette période, il remporte pour la première fois les 24 Heures de Daytona ainsi que son deuxième titre Tran-Am en 1994 avec l'écurie Cunningham Racing. Puis fait un court passage en Winston Cup Series avant d'obtenir en 2003 son troisième titre en Trans-Am avec l'écurie Rocketsports Racing.