Sean Harris est né à Bethnal Green, Londres, Angleterre. Il a été formé au London Drama Centre. Il est apparu dans le film d'horreur Creep en 2004, dans lequel il joue un tueur psychopathe qui traque le métro de Londres. Il apparait également dans le film britannique Saxon(en), sorti en 2008.
Harris apparait dans le court métrageNative Son, où il tient le rôle d'un soldat troublé qui rentre chez lui après une guerre à l'étranger, et éprouvant des difficultés à retomber dans la vie rurale. Le film est écrit et réalisé par l'Écossais Graham Scott, il est présenté au Festival de Cannes 2010. En 2012, l'acteur joue dans le film de Ridley ScottPrometheus[2].
En 2022, il apparaît sous les traits de Henry Peter Teague / Peter Morley, le personnage principal, dans The Stranger. Puis, en 2023, il rejoint le casting de la série de la BBC The Gold, entourant les événements du vol de la Brink's Mat de 1983.
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