À la suite du tremblement de terre de 1693, la ville de Noto, comme d'autres dans la région, fut entièrement reconstruite sur un nouveau site, et l’on doit à Sinatra un grand nombre des bâtiments de la nouvelle cité. Parmi eux, on compte l’église Monte Vergine, l’église San Giovanni Battista et la basilique Santa Maria Maggiore à Ispica. L’une de ses réalisations les plus remarquables est le Palazzo Ducezio (aujourd’hui transformé en mairie), entamé en 1746.