1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour : 21 décembre 2021
Vladimir Stojković est issu d'une famille de sportif, sa mère était handballeuse, son père gardien de but de football et son jeune frère est, lui aussi, gardien de but[2].
La saison 2005-2006 est couronnée de succès. Il réalise le doublé Coupe-Championnat avec son club. Alors qu'il dispute l'Euro espoirs, il est désigné capitaine de la sélection serbe en l'absence de Danko Lazović. La sélection est éliminée par l'Ukraine en demi-finale aux tirs au but (0-0 puis 4-5). Le mois suivant il est sélectionné pour être le troisième gardien de la sélection nationale derrière à la Coupe du monde 2006. Il n'entre pas en jeu mais joue son premier match de sélection le contre la République tchèque (3-1).
Il est alors recruté par le FC Nantes pour la saison 2006-2007. Il a la lourde tâche de remplacer Mickaël Landreau, parti au PSG. Le recrutement est ambitieux, Christian Wilhelmsson et Nourdin Boukhari, notamment font espérer une bonne saison des Canaris. Le mauvais début de saison accentue l'instabilité du club (3 changements d'entraîneurs et 4 gardiens utilisés en une saison). Le Serbe perd sa place au profit de Vincent Briant. Il est même exclu du groupe professionnel plusieurs fois par Serge Le Dizet. L'arrivée de Fabien Barthez en décembre le convainc de partir ; il est alors prêté 6 mois au Vitesse Arnhem, aux Pays-Bas[3]. Il joue 8 matchs, le club termine 12e mais ne convainc pas ses dirigeants de le garder.
De retour à Nantes, le club a besoin de liquidités pour combler les frais de la descente en Ligue 2 et les dépenses faites la saison précédente ; le , il s'engage pour le Sporting Clube de Portugal pour 1 million d'euros[4]. Il débute bien la saison, notamment avec la victoire 1-0 en Supercoupe du Portugal contre le FC Porto le . S'ensuivent de bon débuts avec la victoire 4-1 le contre l'Acadelica Coimbra. En octobre, il perd sa place au profit de Rui Patrício, l'entraîneur Paulo Bento le relègue 3e gardien. Il le sanctionne à cause d'un retour tardif de sélection[5].
En juillet 2008, il fait un essai au Everton FC pour un transfert entre 2,5 et 3 millions d'euros[6]; cet essai s'avère finalement non concluant. Il débute donc la saison 2008-2009 au Sporting, où il ne joue pas. En janvier 2009, il est prêté à Getafe CF, pour remplacer Roberto Abbondanzieri parti à Boca Juniors[7]. Il débute en Liga le lors de la victoire 1-0 contre le FC Séville. Il ne joue que 5 matchs et n'est pas conservé par le club espagnol.
Malgré son statut de remplaçant en club, Stojković reste le gardien titulaire en sélection où il réalise des prestations en dents de scie. Le , lors d'un match comptant pour les éliminatoires de la Coupe du monde 2010, il permet notamment à Thierry Henry et à la France d'égaliser en relâchant un ballon dans les pieds de l'attaquant barcelonais à la suite d'une frappe anodine de Nicolas Anelka.
Le , le Sporting annonce sur son site officiel la résiliation du contrat de Stojković.