Ala grande di 2,09 metri per circa 113 chili di peso, è stato il primo giocatore greco ad aver indossato la maglia di una squadra NBA, disputando la stagione 2001-02 con i Memphis Grizzlies; in un incontro con gli Orlando Magic segnò il suo massimo in carriera nell'NBA, realizzando 21 punti.
Proveniente dal Panathinaikos di Atene, dopo l'esperienza negli Stati Uniti Fotsis è approdato nel 2003 al Real Madrid per 2 stagioni, aggirandosi attorno ai 10 punti di media a partita.
Nel 2006-07 ha giocato con la Dinamo Mosca segnando 11,2 punti a partita nel campionato russo e ben 13,8 in Eurolega. Proprio in Eurolega, è stato protagonista di un'eccezionale performance il 21 marzo 2007: in una partita fra Dinamo Mosca e Benetton Treviso valida per l'accesso ai quarti di finale, Fotsis segnò 22 punti e catturò la bellezza di 24 rimbalzi, nuovo record per una partita di Eurolega; la Dinamo vinse per 68-65 all'overtime. Nella stagione 2008-09 torna a giocare per il Panathinaikos B.C. con cui vince l'Eurolega.
Al termine del contratto biennale che lo legava all'Olimpia Milano, nella stagione 2013-2014 torna al Panathinaikos per concludere la carriera.
Il 2 agosto 2017 si ritira dal basket professionistico per tornare a vestire la maglia dell'Īlysiakos, la squadra con cui ha iniziato la sua carriera a livello amatoriale.[2]
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