Posta lungo il fiume Yonne, è una città di origini antiche che vanta un centro storico d'impronta medievale ben preservato nel quale spiccano due monumenti: la grande cattedrale gotica con la sua imponente facciata e la sua torre in stile fiammeggiante e l'antica abbazia Saint-Germain, romanica e gotica, famosa per la sua cripta ricoperta di affreschi d'epoca carolingia (IX secolo), tra i più antichi conservati in Europa. Sepolcro di San Germano, l'abbazia era un'importante meta di pellegrinaggio fin dall'Antichità tardiva. Auxerre è inoltre sede di un importante centro di ricerche sul Medio Evo.
La città ospita tre musei, che riuniscono collezioni di belle arti, archeologia, storia del territorio e tradizioni locali e scienze naturali. È nel museo di Auxerre che fu ritrovata un'importante statua greca d'epoca arcaica, appunto conosciuta come la Dama di Auxerre, oggi uno dei capolavori del museo del Louvre a Parigi.
Nei pressi di Auxerre si trova la regione di Chablis, dove viene prodotto il vino omonimo, uno dei più pregiati vini della Borgogna, mentre intorno a la città si trovano i vigneti dell'Auxerrois.
In Francia, la città è nota per la squadra di calcio, l'Association de la Jeunesse Auxerroise, che ha vinto il campionato nazionale nel 1996, militando poi in varie coppe europee, e il suo storico allenatore Guy Roux.
La squadra di calcio locale, l'Auxerre, milita nella Ligue 1, la prima serie del campionato francese. Il club ha vinto il campionato francese nella stagione 1995-96.