La gara in linea maschile Under-23 dei Campionati europei di ciclismo su strada 2009 è stata corsa il 5 luglio in Belgio, con partenza da Ostenda ed arrivo a Hooglede, su un percorso totale di 175,5 km. La medaglia d'oro è stata vinta dal belga Kris Boeckmans con il tempo di 3h59'07" alla media di 44,03 km/h, l'argento al polacco Jarosław Marycz e a completare il podio l'italiano Sacha Modolo.