Il confine riguarda la parte nord-orientale dell'Austria e la parte sud della Repubblica Ceca.
Inizia alla triplice frontiera tra Austria, Germania e Repubblica Ceca[1] e poi va verso oriente fino alla triplice frontiera tra Austria, Repubblica Ceca e Slovacchia[2].
Il fiume Thaya (in tedesco) o Dyje (in ceco) scorre sinuosamente lungo un tratto del confine e in particolare tra le regioni della Bassa Austria in Austria e la Moravia Meridionale in Repubblica Ceca.