All'età di cinque anni intraprende gli studi alla Children's School of Intuitive and God-Conscious Art; quindi frequenta la scuola di recitazione e teatroProfessional Children's School, alternando lo studio e la recitazione ad apparizioni sul piccolo e sul grande schermo. Si laurea qualche anno più tardi alla LaGuardia High School of the Performing Arts.
Faison ha avuto il suo primo figlio, Sean, nel 1997. Dal 2001 al 2005 è stato sposato con Lisa Askey, da cui ha avuto tre figli: i gemelli Dade e Kaya (1999) e Kobe (2001). Il 15 dicembre 2012 ha sposato CaCee Cobb, dalla quale ha avuto il suo quinto figlio, Rocco, nato il 16 agosto 2013.
Il 24 aprile 2015 è nata la seconda figlia della coppia, Wilder Frances Faison. Anche nella vita, come nella fiction, il suo migliore amico è Zach Braff (J.D. in Scrubs)
Nel 2005, Donald ha offerto il suo aiuto a Ashton Kutcher nel programma di MTVPunk'd per il 3º episodio della 4ª stagione. In quella puntata, la Porsche da 100.000$ di Zach Braff veniva completamente dipinta con bombolette spray da due teppisti minorenni ai quali Braff e Faison si erano rifiutati di comprare della birra. Sempre nello stesso anno partecipa al video Chariot di Gavin DeGraw, diretto da Zach Braff.
Nel 2008 partecipa al video Beat It dei Fall Out Boy (Cover della canzone originale di Michael Jackson) e nel 2011 appare nello spot del videogame The Sims Medieval.
Nelle versioni in italiano delle opere in cui ha recitato, Donald Faison è stato doppiato da:
Nanni Baldini in Scacco al re nero, Sabrina, vita da strega, Scrubs - Medici ai primi ferri, Big Fat Liar - Una grossa bugia a Hollywood, L'amore non ha colore, Skyline, Hot Bot, Voices, Ray Donovan, Bill Nye Saves the World, Game Over, Man!, Legends of Tomorrow
Corrado Conforti ne Il sapore della vittoria - Uniti si vince, Le ragazze dei quartieri alti, Felicity, Ragazze a Beverly Hills (serie TV)