Era il sesto figlio di Hiram Bingham I (1789-1869), anch'esso missionario. Il padre e la madre partirono da Boston verso Honolulu nel 1819, dove nacque. Frequentò il Williston Seminary a Easthampton e si laureò all'Università Yale nel 1853.
Fu ordinato come sacerdote congregazionalista a New Haven il 9 novembre 1856 e si sposò subito dopo con Clara Brewster a Northampton. I due salparono per Honolulu, dove arrivano il 24 aprile 1857 per diffondervi la fede cristiana presso i nativi hawaiani come parte dell'American Board of Commissioners for Foreign Missions. Dopo un breve ritorno negli Stati Uniti nel 1865, si fermarono di nuovo a Honolulu nel 1867, mentre si dirigevano nelle isole Marchesi.
Bingham II fu il primo missionario a evangelizzare le isole Gilbert e a imparare la loro lingua, traducendo la Bibbia.
Dal 1877 al 1880 fu segretario dell'Hawaiian Board e nel 1895 l'Università Yale gli conferì il Doctorate of Divinity.
Bibliografia
Fathers and sons, the Bingham family and the American mission, by Char Miller, Published by Temple University Press, 1982, ISBN 978-0-87722-248-4