Jovana Jakšić ha iniziato a giocare a tennis all'età di 8 anni.
A livello giovanile, arrivò ad essere l'11ª nel ranking junior in singolare. Nel 2009 giunse ai quarti al Wilson ITF Junior Classic, mentre al Malta U18 ITF Junior Tournament perse ancora nei quarti in singolare ma vinse il torneo di doppio con Julia Stamanova. Al Nazmi Bari Cup ITF Junior 2009 perse la finale contro Nigina Abduraimova, la stessa giocatrice che l'avrebbe battuta in finale al Enka ITF Junior 2009. Al Mediterranee Avenir perse in semifinale contro Mai Grace. Al Pancevo International 2009 vinse il torneo di doppio insieme a Doroteja Eric.
Nel 2010 perse in semifinale al 22nd Czech International Junior Indoor Championships contro Magda Linette. Al 9th Monastir ITF Junior Tournament, al ITF/LTAT Junior Championships e al 15th Sarawak Chief Minister's Cup - ITF World Junior Tennis Championships 2010 perse nei quarti, mentre al IX Campeonatos Internacionales Junior de Tenis de la Comunidad Valenciana raggiunse la semifinale persa contro Klara Fabikova. Al 11th Gerry Weber Junior Open vinse il torneo di doppio con Irina Chromačëva. Al Pancevo International 2010 perse in finale contro Natalija Kostic, mentre s'impose in doppio al Perin Memorial.
Nel 2011 perse nei quarti al Chang LTAT ITF Junior Championships e in semifinale al 17th Sarawak Chief Minister's Cup. Vinse il primo titolo in singolare al 22nd Mitsubishi-Lancer International Juniors Championships battendo in finale Anett Kontaveit. Al 28th International Tournament of Salsomaggiore vinse in doppio insieme a Lucia Butkovska. Al 19th International Junior Tournament of Offenbach perse in finale in singolare contro Montserrat Gonzalez, mentre vinse in doppio con Stephanie Nauta. Al ITF Junior Open Linz perse in semifinale contro Klara Fabikova. S'impose, invece, al Pancevo International battendo in finale Irina Maria Bara, mentre perse in finale al 13th Serbia Junior Open Novi Sad 2011 contro Ilka Csoregi.
Professionismo
Jovana ha vinto 13 titoli ITF in singolare. Il 26 agosto 2013 ha raggiunto il best ranking al numero 159 in singolare.
Nel 2009, inizia a giocare i primi tornei ITF raggiungendo i quarti a Prokuplje, e il secondo turno a Prokuplje 2 e a Monastir. L'anno seguente raggiunge come migliori piazzamenti il secondo turno ai tornei di Vic, Prokuplje, Prokuplje 2 e a Osijek. Nel 2011 vince due tornei, a Prokuplje 2 e ad Antalya, mentre perde in finale in tre occasioni (Vincovci, Plovdiv, Pirot) e in semifinale ad Osijek. Nel 2012, vince altri sei titoli (cinque ad Antalya ed uno a Mumbai), e perde nei quarti nei tornei di Sarajevo, Niš, Prokuplje ed Antalya. Nel 2013, vince altri tre titoli (due ad Antalya ed uno a Poza Rica) e perde una finale sempre ad Antalya. Nell'aprile dello stesso anno, debutta in un main-draw del circuito WTA al Monterrey Open 2013 superando anche le qualificazioni e battendo al primo turno l'ex top 50 Vera Duševina, per poi essere battuta da Marija Kirilenko per 6-0, 4-6, 6-1. Al Guangzhou International Women's Open 2013, passa le qualificazioni ma viene sconfitta al primo turno da Laura Robson.
Nel 2014 partecipa al torneo di Monterrey raggiungendo la finale (prima WTA in carriera). Nell'atto conclusivo si arrende all'onnipotenza di Ana Ivanović che la demolisce per 6-2 6-1