La nazionale di pallacanestro dell'Estonia (Eesti korvpallikoondis), selezione composta dai migliori giocatori di pallacanestro di nazionalità estone, rappresenta l'Estonia nelle competizioni internazionali di pallacanestro organizzate dalla FIBA, ed è gestita dalla Federazione cestistica dell'Estonia.
La nazionale estone ha presenziato a due edizione dell'Europeo negli anni trenta chiudendo in entrambe le occasioni al quinto posto.
È stata presente all'Olimpiade di Berlino del 1936, la prima edizione in cui la pallacanestro era presente ufficialmente. In questa occasione, il team estone ha avuto l'onore di giocare la prima partita del torneo, e di conseguenza, la prima partita in assoluto del basket alle Olimpiadi, vincendo per 34-29 contro la Francia.
1948-1991 Nazionale sovietica
Dopo la seconda guerra mondiale il paese è stato occupato e inglobato all'Unione sovietica, e ne ha fatto parte fino al 1991, anno in cui l'Estonia ha ristabilito l'indipendenza, e di conseguenza, ha visto riformarsi le sue nazionali sportive.
Nel 1993 è riuscita subito a qualificarsi alla fase finale dell'Campionato Europeo dove ha conquistato il sesto posto.
Nell'edizione del 2001, ha partecipato per la quarta volta alla massima manifestazione continentale finendo all'ultimo posto. Nel 2009 è retrocessa in Division B.
Piazzamenti
Per tutte le manifestazioni, nel periodo 1948-1991, era parte dell'Unione Sovietica, essendo l'Estonia occupata dal regime sovietico.