Nel corso della sua carriera, Paula Fredriksen si è occupata di ricerche sul Gesù storico, ritenendolo un profeta apocalittico ebraico; insieme a Ed Parish Sanders e Géza Vermes, è considerata tra gli studiosi più impegnati ad inquadrare Gesù nel contesto ebraico dell'epoca. La Fredriksen si è interessata anche della storia del cristianesimo dalle origini alla caduta dell'Impero Romano.
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Libri
Augustine on Romans, Chico: Scholars Press, 1982
From Jesus to Christ: The Origins of the New Testament Images of Jesus, Yale University Press, 1988
Jesus of Nazareth, King of the Jews: A Jewish Life and the Emergence of Christianity, Vintage Press, 2000.
Con Adele Reinhartz (coautore), Jesus, Judaism, and Christian Anti-Judaism: Reading the New Testament After the Holocaust, Westminster John Knox Press; 2002.
On The Passion of the Christ: Exploring the Issues Raised by the Controversial Movie, University of California Press, 2006.
Augustine and the Jews: A Christian Defense of Jews and Judaism, Doubleday Religion, 2008.
Sin: The Early History of an Idea, Princeton University Press, 2012
When Christians Were Jews: The First Generation, Yale University Press, 2018