La Prva nogometna liga Federacije Bosne i Hercegovine 2000-2001 (abbreviata in Prva liga FBiH 2000-2001) è stata la prima edizione del massimo campionato di calcio della Federazione BiH, seconda divisione della Bosnia ed Erzegovina.
La Federazione bosniaca si accordò con la Federazione calcistica dell'Erzeg-Bosna per l'unificazione dei propri campionati. Le prime undici classificate della Prva liga NS BiH 1999-2000 e 9 della Prva liga Herceg-Bosne 1999-2000 andarono a formare la Premijer Liga 2000-2001, mentre la federazione della Repubblica Srpska non aderì e organizzò i propri tornei non riconosciuti dalla UEFA.
Per la nuova seconda divisione unita, chiamata Prva liga FBiH, 11 squadre vennero dai campionati dei Bosgnacchi e 7 da quelli dell'Erzeg-Bosnia.
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