Il campionato di Serie A1 di pallacanestro maschile 1998-1999 è stato il settantasettesimo organizzato in Italia.
A questa edizione prendono parte 14 squadre, che si incontrano in un girone all'italiana con partite di andata e ritorno. La vittoria vale 2 punti, la sconfitta 0. Al termine della stagione regolare le prime 12 squadre si qualificano per i play-off. Le prime 4 accedono direttamente ai quarti di finale, mentre le altre 8 si giocano la partecipazione in un turno preliminare al meglio delle 3 partite. Quarti, semifinali e finale si giocano al meglio delle 5 partite.